Protein–RNA interactions for Protein: P56134

ATP5J2, ATP synthase subunit f, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5J2P56134 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP5J2P56134 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP5J2P56134 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP5J2P56134 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP5J2P56134 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP5J2P56134 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP5J2P56134 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP5J2P56134 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP5J2P56134 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP5J2P56134 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP5J2P56134 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP5J2P56134 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP5J2P56134 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP5J2P56134 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP5J2P56134 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP5J2P56134 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP5J2P56134 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP5J2P56134 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP5J2P56134 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP5J2P56134 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP5J2P56134 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP5J2P56134 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP5J2P56134 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP5J2P56134 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP5J2P56134 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP5J2P56134 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATP5J2P56134 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP5J2P56134 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP5J2P56134 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP5J2P56134 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP5J2P56134 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP5J2P56134 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP5J2P56134 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP5J2P56134 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP5J2P56134 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP5J2P56134 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP5J2P56134 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP5J2P56134 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP5J2P56134 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP5J2P56134 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP5J2P56134 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP5J2P56134 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP5J2P56134 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP5J2P56134 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP5J2P56134 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP5J2P56134 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP5J2P56134 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP5J2P56134 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ATP5J2P56134 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP5J2P56134 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP5J2P56134 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP5J2P56134 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP5J2P56134 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP5J2P56134 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP5J2P56134 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP5J2P56134 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP5J2P56134 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP5J2P56134 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP5J2P56134 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP5J2P56134 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP5J2P56134 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP5J2P56134 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP5J2P56134 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP5J2P56134 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP5J2P56134 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP5J2P56134 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP5J2P56134 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP5J2P56134 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP5J2P56134 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP5J2P56134 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP5J2P56134 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP5J2P56134 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP5J2P56134 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP5J2P56134 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP5J2P56134 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATP5J2P56134 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP5J2P56134 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP5J2P56134 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP5J2P56134 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP5J2P56134 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP5J2P56134 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP5J2P56134 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP5J2P56134 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP5J2P56134 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP5J2P56134 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP5J2P56134 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP5J2P56134 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP5J2P56134 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP5J2P56134 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP5J2P56134 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP5J2P56134 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP5J2P56134 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP5J2P56134 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP5J2P56134 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP5J2P56134 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP5J2P56134 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP5J2P56134 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP5J2P56134 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP5J2P56134 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP5J2P56134 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms