Protein–RNA interactions for Protein: P55209

NAP1L1, Nucleosome assembly protein 1-like 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L1P55209 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NAP1L1P55209 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NAP1L1P55209 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NAP1L1P55209 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NAP1L1P55209 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NAP1L1P55209 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NAP1L1P55209 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NAP1L1P55209 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NAP1L1P55209 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NAP1L1P55209 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NAP1L1P55209 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NAP1L1P55209 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
NAP1L1P55209 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NAP1L1P55209 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NAP1L1P55209 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NAP1L1P55209 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NAP1L1P55209 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NAP1L1P55209 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
NAP1L1P55209 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
NAP1L1P55209 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NAP1L1P55209 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NAP1L1P55209 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NAP1L1P55209 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NAP1L1P55209 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NAP1L1P55209 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NAP1L1P55209 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NAP1L1P55209 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NAP1L1P55209 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NAP1L1P55209 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NAP1L1P55209 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NAP1L1P55209 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NAP1L1P55209 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NAP1L1P55209 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NAP1L1P55209 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NAP1L1P55209 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NAP1L1P55209 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NAP1L1P55209 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NAP1L1P55209 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NAP1L1P55209 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NAP1L1P55209 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NAP1L1P55209 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NAP1L1P55209 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NAP1L1P55209 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NAP1L1P55209 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NAP1L1P55209 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NAP1L1P55209 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NAP1L1P55209 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NAP1L1P55209 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
NAP1L1P55209 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NAP1L1P55209 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NAP1L1P55209 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NAP1L1P55209 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NAP1L1P55209 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NAP1L1P55209 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NAP1L1P55209 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NAP1L1P55209 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
NAP1L1P55209 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NAP1L1P55209 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NAP1L1P55209 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NAP1L1P55209 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NAP1L1P55209 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NAP1L1P55209 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NAP1L1P55209 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NAP1L1P55209 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NAP1L1P55209 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
NAP1L1P55209 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NAP1L1P55209 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
NAP1L1P55209 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NAP1L1P55209 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NAP1L1P55209 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NAP1L1P55209 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NAP1L1P55209 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NAP1L1P55209 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NAP1L1P55209 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NAP1L1P55209 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NAP1L1P55209 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NAP1L1P55209 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NAP1L1P55209 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NAP1L1P55209 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NAP1L1P55209 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NAP1L1P55209 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NAP1L1P55209 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NAP1L1P55209 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NAP1L1P55209 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NAP1L1P55209 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NAP1L1P55209 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NAP1L1P55209 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NAP1L1P55209 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NAP1L1P55209 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NAP1L1P55209 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NAP1L1P55209 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NAP1L1P55209 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NAP1L1P55209 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NAP1L1P55209 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NAP1L1P55209 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NAP1L1P55209 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NAP1L1P55209 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NAP1L1P55209 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NAP1L1P55209 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NAP1L1P55209 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms