Protein–RNA interactions for Protein: P53990

IST1, IST1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IST1P53990 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
IST1P53990 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
IST1P53990 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
IST1P53990 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
IST1P53990 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
IST1P53990 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
IST1P53990 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
IST1P53990 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
IST1P53990 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
IST1P53990 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
IST1P53990 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
IST1P53990 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
IST1P53990 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
IST1P53990 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
IST1P53990 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
IST1P53990 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
IST1P53990 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
IST1P53990 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
IST1P53990 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
IST1P53990 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
IST1P53990 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
IST1P53990 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
IST1P53990 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
IST1P53990 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
IST1P53990 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
IST1P53990 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
IST1P53990 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
IST1P53990 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
IST1P53990 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
IST1P53990 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
IST1P53990 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
IST1P53990 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
IST1P53990 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
IST1P53990 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
IST1P53990 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
IST1P53990 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
IST1P53990 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
IST1P53990 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
IST1P53990 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
IST1P53990 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
IST1P53990 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
IST1P53990 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
IST1P53990 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
IST1P53990 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
IST1P53990 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
IST1P53990 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
IST1P53990 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
IST1P53990 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
IST1P53990 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
IST1P53990 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
IST1P53990 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
IST1P53990 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
IST1P53990 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
IST1P53990 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
IST1P53990 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
IST1P53990 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
IST1P53990 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
IST1P53990 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
IST1P53990 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
IST1P53990 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
IST1P53990 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IST1P53990 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
IST1P53990 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
IST1P53990 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
IST1P53990 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IST1P53990 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
IST1P53990 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IST1P53990 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IST1P53990 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
IST1P53990 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
IST1P53990 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
IST1P53990 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
IST1P53990 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
IST1P53990 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
IST1P53990 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
IST1P53990 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
IST1P53990 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
IST1P53990 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
IST1P53990 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
IST1P53990 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
IST1P53990 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
IST1P53990 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
IST1P53990 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
IST1P53990 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
IST1P53990 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
IST1P53990 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
IST1P53990 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
IST1P53990 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
IST1P53990 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
IST1P53990 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
IST1P53990 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
IST1P53990 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IST1P53990 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IST1P53990 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IST1P53990 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
IST1P53990 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IST1P53990 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
IST1P53990 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
IST1P53990 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
IST1P53990 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms