Protein–RNA interactions for Protein: P53667

LIMK1, LIM domain kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMK1P53667 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LIMK1P53667 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LIMK1P53667 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LIMK1P53667 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LIMK1P53667 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LIMK1P53667 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LIMK1P53667 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
LIMK1P53667 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LIMK1P53667 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LIMK1P53667 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LIMK1P53667 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LIMK1P53667 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
LIMK1P53667 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LIMK1P53667 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LIMK1P53667 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LIMK1P53667 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LIMK1P53667 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LIMK1P53667 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LIMK1P53667 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LIMK1P53667 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LIMK1P53667 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LIMK1P53667 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LIMK1P53667 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
LIMK1P53667 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
LIMK1P53667 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LIMK1P53667 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LIMK1P53667 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LIMK1P53667 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LIMK1P53667 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LIMK1P53667 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LIMK1P53667 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LIMK1P53667 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LIMK1P53667 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LIMK1P53667 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LIMK1P53667 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LIMK1P53667 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
LIMK1P53667 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
LIMK1P53667 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
LIMK1P53667 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LIMK1P53667 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LIMK1P53667 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LIMK1P53667 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LIMK1P53667 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LIMK1P53667 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
LIMK1P53667 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LIMK1P53667 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LIMK1P53667 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LIMK1P53667 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LIMK1P53667 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LIMK1P53667 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LIMK1P53667 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LIMK1P53667 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LIMK1P53667 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
LIMK1P53667 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
LIMK1P53667 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LIMK1P53667 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LIMK1P53667 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
LIMK1P53667 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
LIMK1P53667 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
LIMK1P53667 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LIMK1P53667 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.52■■■□□ 2
LIMK1P53667 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.52■■■□□ 2
LIMK1P53667 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LIMK1P53667 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LIMK1P53667 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
LIMK1P53667 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LIMK1P53667 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LIMK1P53667 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LIMK1P53667 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LIMK1P53667 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LIMK1P53667 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LIMK1P53667 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LIMK1P53667 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LIMK1P53667 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LIMK1P53667 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LIMK1P53667 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LIMK1P53667 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LIMK1P53667 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LIMK1P53667 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LIMK1P53667 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LIMK1P53667 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LIMK1P53667 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LIMK1P53667 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LIMK1P53667 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LIMK1P53667 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LIMK1P53667 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LIMK1P53667 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LIMK1P53667 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LIMK1P53667 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LIMK1P53667 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LIMK1P53667 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LIMK1P53667 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LIMK1P53667 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LIMK1P53667 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LIMK1P53667 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LIMK1P53667 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
LIMK1P53667 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LIMK1P53667 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LIMK1P53667 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LIMK1P53667 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms