Protein–RNA interactions for Protein: P48634

PRRC2A, Protein PRRC2A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC2AP48634 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRRC2AP48634 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRRC2AP48634 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRRC2AP48634 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRRC2AP48634 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PRRC2AP48634 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRRC2AP48634 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRRC2AP48634 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRRC2AP48634 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PRRC2AP48634 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRRC2AP48634 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRRC2AP48634 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRRC2AP48634 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRRC2AP48634 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRRC2AP48634 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRRC2AP48634 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PRRC2AP48634 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRRC2AP48634 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRRC2AP48634 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PRRC2AP48634 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRRC2AP48634 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRRC2AP48634 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PRRC2AP48634 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PRRC2AP48634 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRRC2AP48634 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRRC2AP48634 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PRRC2AP48634 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRRC2AP48634 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRRC2AP48634 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRRC2AP48634 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRRC2AP48634 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRRC2AP48634 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRRC2AP48634 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRRC2AP48634 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRRC2AP48634 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRRC2AP48634 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRRC2AP48634 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRRC2AP48634 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRRC2AP48634 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRRC2AP48634 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRRC2AP48634 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRRC2AP48634 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PRRC2AP48634 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRRC2AP48634 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRRC2AP48634 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRRC2AP48634 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRRC2AP48634 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRRC2AP48634 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
PRRC2AP48634 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRRC2AP48634 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRRC2AP48634 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRRC2AP48634 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRRC2AP48634 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRRC2AP48634 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRRC2AP48634 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRRC2AP48634 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRRC2AP48634 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRRC2AP48634 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRRC2AP48634 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRRC2AP48634 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRRC2AP48634 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRRC2AP48634 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRRC2AP48634 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRRC2AP48634 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRRC2AP48634 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRRC2AP48634 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRRC2AP48634 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRRC2AP48634 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRRC2AP48634 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRRC2AP48634 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRRC2AP48634 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PRRC2AP48634 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRRC2AP48634 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRRC2AP48634 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRRC2AP48634 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRRC2AP48634 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRRC2AP48634 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRRC2AP48634 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRRC2AP48634 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRRC2AP48634 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PRRC2AP48634 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRRC2AP48634 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRRC2AP48634 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRRC2AP48634 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRRC2AP48634 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRRC2AP48634 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRRC2AP48634 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRRC2AP48634 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRRC2AP48634 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRRC2AP48634 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRRC2AP48634 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRRC2AP48634 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRRC2AP48634 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRRC2AP48634 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRRC2AP48634 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRRC2AP48634 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRRC2AP48634 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRRC2AP48634 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRRC2AP48634 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRRC2AP48634 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms