Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
SSFA2P28290 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
SSFA2P28290 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
SSFA2P28290 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC36.31■■■■□ 3.4
SSFA2P28290 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
SSFA2P28290 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
SSFA2P28290 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
SSFA2P28290 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
SSFA2P28290 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC36.26■■■■□ 3.4
SSFA2P28290 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC36.26■■■■□ 3.39
SSFA2P28290 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
SSFA2P28290 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
SSFA2P28290 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
SSFA2P28290 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
SSFA2P28290 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
SSFA2P28290 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
SSFA2P28290 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
SSFA2P28290 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
SSFA2P28290 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
SSFA2P28290 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
SSFA2P28290 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
SSFA2P28290 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
SSFA2P28290 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
SSFA2P28290 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
SSFA2P28290 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
SSFA2P28290 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
SSFA2P28290 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
SSFA2P28290 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
SSFA2P28290 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
SSFA2P28290 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC36.07■■■■□ 3.36
SSFA2P28290 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
SSFA2P28290 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
SSFA2P28290 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
SSFA2P28290 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
SSFA2P28290 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
SSFA2P28290 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
SSFA2P28290 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
SSFA2P28290 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC35.95■■■■□ 3.35
SSFA2P28290 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
SSFA2P28290 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
SSFA2P28290 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
SSFA2P28290 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
SSFA2P28290 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
SSFA2P28290 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
SSFA2P28290 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
SSFA2P28290 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
SSFA2P28290 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
SSFA2P28290 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC35.88■■■■□ 3.33
SSFA2P28290 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC35.86■■■■□ 3.33
SSFA2P28290 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
SSFA2P28290 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC35.83■■■■□ 3.33
SSFA2P28290 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
SSFA2P28290 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
SSFA2P28290 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC35.81■■■■□ 3.32
SSFA2P28290 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
SSFA2P28290 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
SSFA2P28290 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
SSFA2P28290 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
SSFA2P28290 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
SSFA2P28290 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
SSFA2P28290 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
SSFA2P28290 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
SSFA2P28290 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
SSFA2P28290 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
SSFA2P28290 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
SSFA2P28290 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
SSFA2P28290 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
SSFA2P28290 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
SSFA2P28290 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
SSFA2P28290 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
SSFA2P28290 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC35.65■■■■□ 3.3
SSFA2P28290 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
SSFA2P28290 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.64■■■■□ 3.3
SSFA2P28290 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
SSFA2P28290 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
SSFA2P28290 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
SSFA2P28290 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.6■■■■□ 3.29
SSFA2P28290 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
SSFA2P28290 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
SSFA2P28290 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
SSFA2P28290 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
SSFA2P28290 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
SSFA2P28290 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC35.52■■■■□ 3.28
SSFA2P28290 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
SSFA2P28290 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC35.5■■■■□ 3.27
SSFA2P28290 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC35.5■■■■□ 3.27
SSFA2P28290 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
SSFA2P28290 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
SSFA2P28290 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
SSFA2P28290 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
SSFA2P28290 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
SSFA2P28290 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
SSFA2P28290 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
SSFA2P28290 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
SSFA2P28290 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
SSFA2P28290 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
SSFA2P28290 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
SSFA2P28290 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
SSFA2P28290 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
SSFA2P28290 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms