Protein–RNA interactions for Protein: P17544

ATF7, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF7P17544 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
ATF7P17544 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC30.56■■■□□ 2.48
ATF7P17544 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
ATF7P17544 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
ATF7P17544 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
ATF7P17544 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
ATF7P17544 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
ATF7P17544 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
ATF7P17544 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
ATF7P17544 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
ATF7P17544 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
ATF7P17544 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ATF7P17544 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
ATF7P17544 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
ATF7P17544 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
ATF7P17544 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
ATF7P17544 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
ATF7P17544 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
ATF7P17544 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
ATF7P17544 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
ATF7P17544 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
ATF7P17544 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
ATF7P17544 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
ATF7P17544 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ATF7P17544 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
ATF7P17544 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
ATF7P17544 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
ATF7P17544 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
ATF7P17544 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
ATF7P17544 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
ATF7P17544 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
ATF7P17544 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
ATF7P17544 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
ATF7P17544 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ATF7P17544 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
ATF7P17544 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
ATF7P17544 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ATF7P17544 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
ATF7P17544 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
ATF7P17544 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
ATF7P17544 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ATF7P17544 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ATF7P17544 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ATF7P17544 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ATF7P17544 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ATF7P17544 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ATF7P17544 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ATF7P17544 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ATF7P17544 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ATF7P17544 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
ATF7P17544 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ATF7P17544 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
ATF7P17544 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ATF7P17544 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
ATF7P17544 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ATF7P17544 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ATF7P17544 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ATF7P17544 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ATF7P17544 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ATF7P17544 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ATF7P17544 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ATF7P17544 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ATF7P17544 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ATF7P17544 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ATF7P17544 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
ATF7P17544 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
ATF7P17544 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ATF7P17544 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ATF7P17544 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ATF7P17544 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ATF7P17544 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ATF7P17544 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
ATF7P17544 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ATF7P17544 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ATF7P17544 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ATF7P17544 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
ATF7P17544 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
ATF7P17544 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ATF7P17544 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ATF7P17544 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ATF7P17544 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ATF7P17544 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ATF7P17544 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ATF7P17544 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ATF7P17544 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ATF7P17544 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ATF7P17544 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
ATF7P17544 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ATF7P17544 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ATF7P17544 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ATF7P17544 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ATF7P17544 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ATF7P17544 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ATF7P17544 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ATF7P17544 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
ATF7P17544 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
ATF7P17544 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ATF7P17544 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ATF7P17544 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
ATF7P17544 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms