Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
VAV1P15498 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
VAV1P15498 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
VAV1P15498 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
VAV1P15498 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
VAV1P15498 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
VAV1P15498 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
VAV1P15498 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
VAV1P15498 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
VAV1P15498 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
VAV1P15498 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
VAV1P15498 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
VAV1P15498 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
VAV1P15498 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
VAV1P15498 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
VAV1P15498 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
VAV1P15498 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
VAV1P15498 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
VAV1P15498 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
VAV1P15498 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
VAV1P15498 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
VAV1P15498 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
VAV1P15498 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
VAV1P15498 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
VAV1P15498 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
VAV1P15498 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
VAV1P15498 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
VAV1P15498 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
VAV1P15498 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
VAV1P15498 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
VAV1P15498 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
VAV1P15498 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
VAV1P15498 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
VAV1P15498 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
VAV1P15498 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
VAV1P15498 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
VAV1P15498 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
VAV1P15498 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
VAV1P15498 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
VAV1P15498 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
VAV1P15498 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
VAV1P15498 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
VAV1P15498 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
VAV1P15498 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
VAV1P15498 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
VAV1P15498 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
VAV1P15498 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
VAV1P15498 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
VAV1P15498 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
VAV1P15498 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
VAV1P15498 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
VAV1P15498 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
VAV1P15498 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
VAV1P15498 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
VAV1P15498 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
VAV1P15498 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
VAV1P15498 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
VAV1P15498 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
VAV1P15498 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
VAV1P15498 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
VAV1P15498 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
VAV1P15498 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
VAV1P15498 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
VAV1P15498 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
VAV1P15498 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
VAV1P15498 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
VAV1P15498 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
VAV1P15498 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
VAV1P15498 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
VAV1P15498 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
VAV1P15498 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
VAV1P15498 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
VAV1P15498 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
VAV1P15498 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
VAV1P15498 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
VAV1P15498 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
VAV1P15498 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
VAV1P15498 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
VAV1P15498 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
VAV1P15498 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
VAV1P15498 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
VAV1P15498 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
VAV1P15498 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
VAV1P15498 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
VAV1P15498 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
VAV1P15498 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
VAV1P15498 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
VAV1P15498 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
VAV1P15498 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
VAV1P15498 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
VAV1P15498 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
VAV1P15498 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
VAV1P15498 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
VAV1P15498 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
VAV1P15498 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
VAV1P15498 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
VAV1P15498 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
VAV1P15498 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
VAV1P15498 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
VAV1P15498 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.3 ms