Protein–RNA interactions for Protein: P13473

LAMP2, Lysosome-associated membrane glycoprotein 2, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMP2P13473 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LAMP2P13473 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
LAMP2P13473 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
LAMP2P13473 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LAMP2P13473 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LAMP2P13473 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
LAMP2P13473 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
LAMP2P13473 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LAMP2P13473 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LAMP2P13473 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LAMP2P13473 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LAMP2P13473 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LAMP2P13473 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
LAMP2P13473 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
LAMP2P13473 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
LAMP2P13473 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
LAMP2P13473 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LAMP2P13473 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LAMP2P13473 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LAMP2P13473 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LAMP2P13473 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
LAMP2P13473 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
LAMP2P13473 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
LAMP2P13473 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
LAMP2P13473 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LAMP2P13473 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
LAMP2P13473 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LAMP2P13473 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LAMP2P13473 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
LAMP2P13473 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
LAMP2P13473 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LAMP2P13473 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LAMP2P13473 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LAMP2P13473 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
LAMP2P13473 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
LAMP2P13473 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29■■■□□ 2.23
LAMP2P13473 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LAMP2P13473 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LAMP2P13473 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LAMP2P13473 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
LAMP2P13473 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
LAMP2P13473 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
LAMP2P13473 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
LAMP2P13473 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
LAMP2P13473 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
LAMP2P13473 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
LAMP2P13473 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LAMP2P13473 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LAMP2P13473 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LAMP2P13473 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LAMP2P13473 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
LAMP2P13473 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LAMP2P13473 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
LAMP2P13473 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
LAMP2P13473 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LAMP2P13473 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LAMP2P13473 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
LAMP2P13473 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
LAMP2P13473 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
LAMP2P13473 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LAMP2P13473 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LAMP2P13473 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LAMP2P13473 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LAMP2P13473 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LAMP2P13473 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LAMP2P13473 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LAMP2P13473 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LAMP2P13473 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
LAMP2P13473 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
LAMP2P13473 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LAMP2P13473 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LAMP2P13473 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LAMP2P13473 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LAMP2P13473 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LAMP2P13473 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LAMP2P13473 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LAMP2P13473 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LAMP2P13473 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LAMP2P13473 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LAMP2P13473 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LAMP2P13473 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LAMP2P13473 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LAMP2P13473 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
LAMP2P13473 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
LAMP2P13473 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
LAMP2P13473 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
LAMP2P13473 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LAMP2P13473 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
LAMP2P13473 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LAMP2P13473 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
LAMP2P13473 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
LAMP2P13473 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LAMP2P13473 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LAMP2P13473 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
LAMP2P13473 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
LAMP2P13473 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LAMP2P13473 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LAMP2P13473 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LAMP2P13473 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LAMP2P13473 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms