Protein–RNA interactions for Protein: P11802

CDK4, Cyclin-dependent kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK4P11802 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDK4P11802 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDK4P11802 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDK4P11802 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDK4P11802 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDK4P11802 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDK4P11802 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CDK4P11802 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
CDK4P11802 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CDK4P11802 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDK4P11802 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CDK4P11802 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDK4P11802 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDK4P11802 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDK4P11802 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDK4P11802 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDK4P11802 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDK4P11802 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDK4P11802 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDK4P11802 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDK4P11802 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDK4P11802 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDK4P11802 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDK4P11802 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDK4P11802 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDK4P11802 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDK4P11802 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CDK4P11802 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CDK4P11802 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDK4P11802 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDK4P11802 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CDK4P11802 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDK4P11802 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CDK4P11802 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CDK4P11802 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDK4P11802 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDK4P11802 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDK4P11802 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDK4P11802 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDK4P11802 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDK4P11802 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CDK4P11802 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CDK4P11802 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDK4P11802 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDK4P11802 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDK4P11802 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDK4P11802 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDK4P11802 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CDK4P11802 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDK4P11802 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDK4P11802 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CDK4P11802 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDK4P11802 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDK4P11802 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDK4P11802 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDK4P11802 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDK4P11802 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDK4P11802 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDK4P11802 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDK4P11802 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDK4P11802 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDK4P11802 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDK4P11802 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDK4P11802 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDK4P11802 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDK4P11802 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDK4P11802 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDK4P11802 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDK4P11802 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDK4P11802 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDK4P11802 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDK4P11802 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
CDK4P11802 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDK4P11802 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDK4P11802 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDK4P11802 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDK4P11802 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDK4P11802 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CDK4P11802 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDK4P11802 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDK4P11802 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDK4P11802 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CDK4P11802 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CDK4P11802 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDK4P11802 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CDK4P11802 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDK4P11802 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDK4P11802 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDK4P11802 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDK4P11802 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDK4P11802 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CDK4P11802 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDK4P11802 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CDK4P11802 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDK4P11802 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDK4P11802 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDK4P11802 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDK4P11802 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CDK4P11802 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CDK4P11802 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms