Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
LAMC1P11047 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
LAMC1P11047 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
LAMC1P11047 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
LAMC1P11047 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC40.18■■■■■ 4.02
LAMC1P11047 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
LAMC1P11047 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
LAMC1P11047 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.06■■■■■ 4
LAMC1P11047 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC40.05■■■■■ 4
LAMC1P11047 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
LAMC1P11047 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.04■■■■■ 4
LAMC1P11047 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC40.04■■■■■ 4
LAMC1P11047 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC40.03■■■■■ 4
LAMC1P11047 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
LAMC1P11047 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC40.02■■■■■ 4
LAMC1P11047 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
LAMC1P11047 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
LAMC1P11047 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.98■■■■□ 3.99
LAMC1P11047 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC39.93■■■■□ 3.98
LAMC1P11047 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
LAMC1P11047 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
LAMC1P11047 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
LAMC1P11047 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC39.91■■■■□ 3.98
LAMC1P11047 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
LAMC1P11047 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.89■■■■□ 3.98
LAMC1P11047 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
LAMC1P11047 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC39.88■■■■□ 3.97
LAMC1P11047 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
LAMC1P11047 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
LAMC1P11047 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
LAMC1P11047 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC39.84■■■■□ 3.97
LAMC1P11047 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
LAMC1P11047 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC39.8■■■■□ 3.96
LAMC1P11047 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
LAMC1P11047 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC39.78■■■■□ 3.96
LAMC1P11047 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC39.77■■■■□ 3.96
LAMC1P11047 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC39.76■■■■□ 3.96
LAMC1P11047 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC39.74■■■■□ 3.95
LAMC1P11047 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC39.73■■■■□ 3.95
LAMC1P11047 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
LAMC1P11047 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC39.69■■■■□ 3.94
LAMC1P11047 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
LAMC1P11047 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
LAMC1P11047 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.65■■■■□ 3.94
LAMC1P11047 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
LAMC1P11047 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.61■■■■□ 3.93
LAMC1P11047 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC39.61■■■■□ 3.93
LAMC1P11047 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC39.59■■■■□ 3.93
LAMC1P11047 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
LAMC1P11047 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
LAMC1P11047 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.52■■■■□ 3.92
LAMC1P11047 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC39.52■■■■□ 3.92
LAMC1P11047 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
LAMC1P11047 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC39.49■■■■□ 3.91
LAMC1P11047 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
LAMC1P11047 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
LAMC1P11047 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
LAMC1P11047 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC39.49■■■■□ 3.91
LAMC1P11047 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
LAMC1P11047 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC39.47■■■■□ 3.91
LAMC1P11047 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
LAMC1P11047 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
LAMC1P11047 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC39.43■■■■□ 3.9
LAMC1P11047 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
LAMC1P11047 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.43■■■■□ 3.9
LAMC1P11047 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
LAMC1P11047 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
LAMC1P11047 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.37■■■■□ 3.89
LAMC1P11047 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC39.36■■■■□ 3.89
LAMC1P11047 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
LAMC1P11047 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
LAMC1P11047 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
LAMC1P11047 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC39.32■■■■□ 3.89
LAMC1P11047 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
LAMC1P11047 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC39.29■■■■□ 3.88
LAMC1P11047 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC39.26■■■■□ 3.88
LAMC1P11047 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.26■■■■□ 3.88
LAMC1P11047 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC39.26■■■■□ 3.88
LAMC1P11047 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
LAMC1P11047 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.87
LAMC1P11047 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC39.25■■■■□ 3.87
LAMC1P11047 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
LAMC1P11047 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC39.24■■■■□ 3.87
LAMC1P11047 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC39.24■■■■□ 3.87
LAMC1P11047 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
LAMC1P11047 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
LAMC1P11047 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
LAMC1P11047 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC39.23■■■■□ 3.87
LAMC1P11047 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
LAMC1P11047 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
LAMC1P11047 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
LAMC1P11047 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC39.2■■■■□ 3.87
LAMC1P11047 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
LAMC1P11047 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
LAMC1P11047 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
LAMC1P11047 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC39.16■■■■□ 3.86
LAMC1P11047 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC39.16■■■■□ 3.86
LAMC1P11047 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
LAMC1P11047 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
LAMC1P11047 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms