Protein–RNA interactions for Protein: P08118

MSMB, Beta-microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMBP08118 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSMBP08118 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSMBP08118 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MSMBP08118 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MSMBP08118 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MSMBP08118 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MSMBP08118 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MSMBP08118 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MSMBP08118 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MSMBP08118 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MSMBP08118 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MSMBP08118 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MSMBP08118 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MSMBP08118 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MSMBP08118 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
MSMBP08118 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MSMBP08118 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MSMBP08118 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MSMBP08118 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MSMBP08118 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MSMBP08118 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MSMBP08118 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MSMBP08118 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MSMBP08118 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MSMBP08118 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MSMBP08118 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MSMBP08118 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MSMBP08118 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MSMBP08118 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MSMBP08118 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MSMBP08118 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MSMBP08118 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MSMBP08118 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MSMBP08118 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MSMBP08118 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MSMBP08118 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
MSMBP08118 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MSMBP08118 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MSMBP08118 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MSMBP08118 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MSMBP08118 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MSMBP08118 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MSMBP08118 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MSMBP08118 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MSMBP08118 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MSMBP08118 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MSMBP08118 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MSMBP08118 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MSMBP08118 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MSMBP08118 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MSMBP08118 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MSMBP08118 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MSMBP08118 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MSMBP08118 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MSMBP08118 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MSMBP08118 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MSMBP08118 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MSMBP08118 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSMBP08118 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSMBP08118 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MSMBP08118 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSMBP08118 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSMBP08118 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MSMBP08118 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MSMBP08118 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MSMBP08118 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MSMBP08118 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MSMBP08118 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MSMBP08118 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MSMBP08118 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MSMBP08118 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MSMBP08118 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MSMBP08118 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MSMBP08118 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MSMBP08118 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MSMBP08118 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MSMBP08118 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MSMBP08118 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MSMBP08118 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MSMBP08118 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MSMBP08118 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MSMBP08118 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MSMBP08118 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MSMBP08118 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MSMBP08118 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MSMBP08118 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MSMBP08118 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MSMBP08118 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MSMBP08118 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MSMBP08118 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MSMBP08118 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MSMBP08118 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MSMBP08118 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MSMBP08118 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MSMBP08118 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MSMBP08118 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MSMBP08118 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MSMBP08118 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MSMBP08118 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MSMBP08118 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms