Protein–RNA interactions for Protein: P00403

MT-CO2, Cytochrome c oxidase subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MT-CO2P00403 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MT-CO2P00403 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MT-CO2P00403 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MT-CO2P00403 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MT-CO2P00403 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MT-CO2P00403 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MT-CO2P00403 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MT-CO2P00403 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MT-CO2P00403 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MT-CO2P00403 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MT-CO2P00403 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MT-CO2P00403 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MT-CO2P00403 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MT-CO2P00403 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MT-CO2P00403 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MT-CO2P00403 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MT-CO2P00403 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MT-CO2P00403 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MT-CO2P00403 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MT-CO2P00403 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MT-CO2P00403 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MT-CO2P00403 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MT-CO2P00403 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MT-CO2P00403 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MT-CO2P00403 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MT-CO2P00403 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MT-CO2P00403 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MT-CO2P00403 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MT-CO2P00403 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MT-CO2P00403 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MT-CO2P00403 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MT-CO2P00403 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MT-CO2P00403 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MT-CO2P00403 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MT-CO2P00403 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MT-CO2P00403 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MT-CO2P00403 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MT-CO2P00403 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MT-CO2P00403 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MT-CO2P00403 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MT-CO2P00403 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MT-CO2P00403 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MT-CO2P00403 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MT-CO2P00403 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MT-CO2P00403 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MT-CO2P00403 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MT-CO2P00403 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MT-CO2P00403 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MT-CO2P00403 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MT-CO2P00403 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MT-CO2P00403 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MT-CO2P00403 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MT-CO2P00403 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MT-CO2P00403 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MT-CO2P00403 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MT-CO2P00403 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MT-CO2P00403 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MT-CO2P00403 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MT-CO2P00403 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MT-CO2P00403 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MT-CO2P00403 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MT-CO2P00403 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MT-CO2P00403 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MT-CO2P00403 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MT-CO2P00403 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MT-CO2P00403 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MT-CO2P00403 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MT-CO2P00403 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MT-CO2P00403 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MT-CO2P00403 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MT-CO2P00403 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MT-CO2P00403 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MT-CO2P00403 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MT-CO2P00403 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MT-CO2P00403 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MT-CO2P00403 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MT-CO2P00403 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MT-CO2P00403 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MT-CO2P00403 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MT-CO2P00403 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MT-CO2P00403 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MT-CO2P00403 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MT-CO2P00403 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MT-CO2P00403 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MT-CO2P00403 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MT-CO2P00403 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MT-CO2P00403 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MT-CO2P00403 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MT-CO2P00403 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MT-CO2P00403 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MT-CO2P00403 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MT-CO2P00403 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MT-CO2P00403 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MT-CO2P00403 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MT-CO2P00403 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
MT-CO2P00403 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MT-CO2P00403 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MT-CO2P00403 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MT-CO2P00403 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MT-CO2P00403 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms