Protein–RNA interactions for Protein: O96018

APBA3, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA3O96018 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
APBA3O96018 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
APBA3O96018 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
APBA3O96018 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
APBA3O96018 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC37.28■■■■□ 3.56
APBA3O96018 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
APBA3O96018 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
APBA3O96018 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC37.25■■■■□ 3.55
APBA3O96018 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
APBA3O96018 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC37.21■■■■□ 3.55
APBA3O96018 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
APBA3O96018 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
APBA3O96018 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
APBA3O96018 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
APBA3O96018 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
APBA3O96018 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
APBA3O96018 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
APBA3O96018 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
APBA3O96018 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC37.14■■■■□ 3.54
APBA3O96018 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC37.11■■■■□ 3.53
APBA3O96018 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
APBA3O96018 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
APBA3O96018 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC37.08■■■■□ 3.53
APBA3O96018 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
APBA3O96018 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.08■■■■□ 3.53
APBA3O96018 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
APBA3O96018 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
APBA3O96018 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
APBA3O96018 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC37.07■■■■□ 3.53
APBA3O96018 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
APBA3O96018 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC37.05■■■■□ 3.52
APBA3O96018 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC37.02■■■■□ 3.52
APBA3O96018 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC36.98■■■■□ 3.51
APBA3O96018 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
APBA3O96018 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
APBA3O96018 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC36.92■■■■□ 3.5
APBA3O96018 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.91■■■■□ 3.5
APBA3O96018 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC36.91■■■■□ 3.5
APBA3O96018 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
APBA3O96018 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
APBA3O96018 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
APBA3O96018 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
APBA3O96018 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC36.88■■■■□ 3.49
APBA3O96018 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC36.88■■■■□ 3.49
APBA3O96018 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
APBA3O96018 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
APBA3O96018 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
APBA3O96018 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
APBA3O96018 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.48
APBA3O96018 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC36.82■■■■□ 3.48
APBA3O96018 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
APBA3O96018 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
APBA3O96018 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
APBA3O96018 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
APBA3O96018 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
APBA3O96018 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
APBA3O96018 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
APBA3O96018 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
APBA3O96018 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC36.72■■■■□ 3.47
APBA3O96018 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
APBA3O96018 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
APBA3O96018 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
APBA3O96018 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
APBA3O96018 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
APBA3O96018 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
APBA3O96018 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
APBA3O96018 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
APBA3O96018 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
APBA3O96018 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
APBA3O96018 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
APBA3O96018 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
APBA3O96018 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
APBA3O96018 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
APBA3O96018 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
APBA3O96018 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
APBA3O96018 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
APBA3O96018 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
APBA3O96018 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
APBA3O96018 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC36.58■■■■□ 3.45
APBA3O96018 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
APBA3O96018 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
APBA3O96018 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
APBA3O96018 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
APBA3O96018 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
APBA3O96018 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC36.48■■■■□ 3.43
APBA3O96018 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
APBA3O96018 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC36.46■■■■□ 3.43
APBA3O96018 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
APBA3O96018 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
APBA3O96018 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
APBA3O96018 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
APBA3O96018 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
APBA3O96018 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
APBA3O96018 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
APBA3O96018 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
APBA3O96018 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
APBA3O96018 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC36.3■■■■□ 3.4
APBA3O96018 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
APBA3O96018 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
APBA3O96018 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms