Protein–RNA interactions for Protein: O75764

TCEA3, Transcription elongation factor A protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA3O75764 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TCEA3O75764 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TCEA3O75764 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TCEA3O75764 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TCEA3O75764 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TCEA3O75764 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TCEA3O75764 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TCEA3O75764 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TCEA3O75764 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TCEA3O75764 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TCEA3O75764 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TCEA3O75764 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TCEA3O75764 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TCEA3O75764 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TCEA3O75764 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
TCEA3O75764 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TCEA3O75764 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TCEA3O75764 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TCEA3O75764 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
TCEA3O75764 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TCEA3O75764 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TCEA3O75764 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TCEA3O75764 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TCEA3O75764 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TCEA3O75764 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TCEA3O75764 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TCEA3O75764 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TCEA3O75764 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TCEA3O75764 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TCEA3O75764 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TCEA3O75764 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TCEA3O75764 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
TCEA3O75764 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TCEA3O75764 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TCEA3O75764 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TCEA3O75764 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TCEA3O75764 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TCEA3O75764 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TCEA3O75764 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TCEA3O75764 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TCEA3O75764 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TCEA3O75764 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TCEA3O75764 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TCEA3O75764 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TCEA3O75764 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TCEA3O75764 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TCEA3O75764 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
TCEA3O75764 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TCEA3O75764 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TCEA3O75764 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TCEA3O75764 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TCEA3O75764 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TCEA3O75764 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TCEA3O75764 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TCEA3O75764 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TCEA3O75764 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TCEA3O75764 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TCEA3O75764 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TCEA3O75764 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TCEA3O75764 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TCEA3O75764 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TCEA3O75764 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TCEA3O75764 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TCEA3O75764 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TCEA3O75764 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TCEA3O75764 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TCEA3O75764 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TCEA3O75764 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TCEA3O75764 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TCEA3O75764 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TCEA3O75764 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TCEA3O75764 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TCEA3O75764 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TCEA3O75764 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TCEA3O75764 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TCEA3O75764 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TCEA3O75764 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TCEA3O75764 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TCEA3O75764 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TCEA3O75764 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TCEA3O75764 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TCEA3O75764 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TCEA3O75764 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TCEA3O75764 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TCEA3O75764 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TCEA3O75764 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TCEA3O75764 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
TCEA3O75764 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
TCEA3O75764 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TCEA3O75764 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TCEA3O75764 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TCEA3O75764 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TCEA3O75764 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TCEA3O75764 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TCEA3O75764 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TCEA3O75764 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TCEA3O75764 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TCEA3O75764 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TCEA3O75764 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TCEA3O75764 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms