Protein–RNA interactions for Protein: O75208

COQ9, Ubiquinone biosynthesis protein COQ9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COQ9O75208 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
COQ9O75208 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
COQ9O75208 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
COQ9O75208 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
COQ9O75208 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
COQ9O75208 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
COQ9O75208 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
COQ9O75208 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
COQ9O75208 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
COQ9O75208 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
COQ9O75208 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
COQ9O75208 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
COQ9O75208 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
COQ9O75208 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
COQ9O75208 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
COQ9O75208 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
COQ9O75208 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
COQ9O75208 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
COQ9O75208 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
COQ9O75208 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
COQ9O75208 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
COQ9O75208 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
COQ9O75208 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
COQ9O75208 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
COQ9O75208 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
COQ9O75208 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
COQ9O75208 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
COQ9O75208 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
COQ9O75208 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
COQ9O75208 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
COQ9O75208 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
COQ9O75208 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
COQ9O75208 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
COQ9O75208 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
COQ9O75208 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
COQ9O75208 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
COQ9O75208 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
COQ9O75208 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
COQ9O75208 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
COQ9O75208 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
COQ9O75208 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
COQ9O75208 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
COQ9O75208 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
COQ9O75208 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
COQ9O75208 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
COQ9O75208 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
COQ9O75208 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
COQ9O75208 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
COQ9O75208 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
COQ9O75208 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
COQ9O75208 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
COQ9O75208 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
COQ9O75208 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
COQ9O75208 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
COQ9O75208 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
COQ9O75208 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
COQ9O75208 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
COQ9O75208 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
COQ9O75208 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
COQ9O75208 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
COQ9O75208 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
COQ9O75208 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
COQ9O75208 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
COQ9O75208 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
COQ9O75208 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
COQ9O75208 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
COQ9O75208 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
COQ9O75208 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
COQ9O75208 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
COQ9O75208 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
COQ9O75208 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
COQ9O75208 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
COQ9O75208 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
COQ9O75208 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
COQ9O75208 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
COQ9O75208 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
COQ9O75208 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
COQ9O75208 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
COQ9O75208 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
COQ9O75208 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
COQ9O75208 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
COQ9O75208 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
COQ9O75208 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
COQ9O75208 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
COQ9O75208 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
COQ9O75208 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
COQ9O75208 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
COQ9O75208 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
COQ9O75208 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
COQ9O75208 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
COQ9O75208 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
COQ9O75208 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
COQ9O75208 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
COQ9O75208 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
COQ9O75208 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
COQ9O75208 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
COQ9O75208 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
COQ9O75208 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
COQ9O75208 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
COQ9O75208 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms