Protein–RNA interactions for Protein: O60662

KLHL41, Kelch-like protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL41O60662 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KLHL41O60662 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KLHL41O60662 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KLHL41O60662 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KLHL41O60662 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KLHL41O60662 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KLHL41O60662 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KLHL41O60662 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
KLHL41O60662 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KLHL41O60662 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KLHL41O60662 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KLHL41O60662 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KLHL41O60662 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KLHL41O60662 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KLHL41O60662 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KLHL41O60662 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KLHL41O60662 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KLHL41O60662 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KLHL41O60662 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KLHL41O60662 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KLHL41O60662 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KLHL41O60662 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KLHL41O60662 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KLHL41O60662 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KLHL41O60662 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KLHL41O60662 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KLHL41O60662 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KLHL41O60662 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KLHL41O60662 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KLHL41O60662 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KLHL41O60662 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KLHL41O60662 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KLHL41O60662 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KLHL41O60662 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KLHL41O60662 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KLHL41O60662 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
KLHL41O60662 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KLHL41O60662 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KLHL41O60662 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KLHL41O60662 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KLHL41O60662 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KLHL41O60662 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KLHL41O60662 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KLHL41O60662 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KLHL41O60662 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KLHL41O60662 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KLHL41O60662 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KLHL41O60662 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KLHL41O60662 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KLHL41O60662 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KLHL41O60662 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KLHL41O60662 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KLHL41O60662 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KLHL41O60662 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KLHL41O60662 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KLHL41O60662 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KLHL41O60662 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KLHL41O60662 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KLHL41O60662 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KLHL41O60662 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KLHL41O60662 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KLHL41O60662 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KLHL41O60662 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
KLHL41O60662 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
KLHL41O60662 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
KLHL41O60662 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KLHL41O60662 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KLHL41O60662 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KLHL41O60662 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KLHL41O60662 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KLHL41O60662 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KLHL41O60662 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KLHL41O60662 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KLHL41O60662 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KLHL41O60662 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KLHL41O60662 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KLHL41O60662 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KLHL41O60662 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KLHL41O60662 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KLHL41O60662 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KLHL41O60662 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KLHL41O60662 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KLHL41O60662 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KLHL41O60662 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KLHL41O60662 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
KLHL41O60662 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KLHL41O60662 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KLHL41O60662 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KLHL41O60662 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KLHL41O60662 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KLHL41O60662 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KLHL41O60662 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KLHL41O60662 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KLHL41O60662 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KLHL41O60662 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KLHL41O60662 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KLHL41O60662 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KLHL41O60662 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KLHL41O60662 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KLHL41O60662 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms