Protein–RNA interactions for Protein: O60333

KIF1B, Kinesin-like protein KIF1B, humanhuman

Predictions only

Length 1,816 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF1BO60333 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
KIF1BO60333 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
KIF1BO60333 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC40.71■■■■■ 4.11
KIF1BO60333 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
KIF1BO60333 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC40.7■■■■■ 4.11
KIF1BO60333 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
KIF1BO60333 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
KIF1BO60333 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC40.68■■■■■ 4.1
KIF1BO60333 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
KIF1BO60333 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC40.65■■■■■ 4.1
KIF1BO60333 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
KIF1BO60333 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC40.63■■■■■ 4.1
KIF1BO60333 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
KIF1BO60333 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
KIF1BO60333 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.6■■■■■ 4.09
KIF1BO60333 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC40.58■■■■■ 4.09
KIF1BO60333 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
KIF1BO60333 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
KIF1BO60333 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC40.54■■■■■ 4.08
KIF1BO60333 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.07
KIF1BO60333 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
KIF1BO60333 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
KIF1BO60333 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
KIF1BO60333 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC40.44■■■■■ 4.06
KIF1BO60333 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
KIF1BO60333 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.39■■■■■ 4.06
KIF1BO60333 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC40.39■■■■■ 4.06
KIF1BO60333 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
KIF1BO60333 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC40.39■■■■■ 4.06
KIF1BO60333 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
KIF1BO60333 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC40.36■■■■■ 4.05
KIF1BO60333 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
KIF1BO60333 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
KIF1BO60333 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC40.32■■■■■ 4.04
KIF1BO60333 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
KIF1BO60333 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC40.3■■■■■ 4.04
KIF1BO60333 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC40.29■■■■■ 4.04
KIF1BO60333 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC40.27■■■■■ 4.04
KIF1BO60333 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
KIF1BO60333 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
KIF1BO60333 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
KIF1BO60333 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
KIF1BO60333 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC40.19■■■■■ 4.02
KIF1BO60333 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.18■■■■■ 4.02
KIF1BO60333 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC40.17■■■■■ 4.02
KIF1BO60333 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC40.16■■■■■ 4.02
KIF1BO60333 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
KIF1BO60333 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.14■■■■■ 4.02
KIF1BO60333 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.02
KIF1BO60333 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC40.13■■■■■ 4.01
KIF1BO60333 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
KIF1BO60333 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.09■■■■■ 4.01
KIF1BO60333 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC40.08■■■■■ 4.01
KIF1BO60333 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC40.08■■■■■ 4.01
KIF1BO60333 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4
KIF1BO60333 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4
KIF1BO60333 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC40.07■■■■■ 4
KIF1BO60333 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC40.05■■■■■ 4
KIF1BO60333 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC40.05■■■■■ 4
KIF1BO60333 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
KIF1BO60333 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
KIF1BO60333 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC40■■■■□ 3.99
KIF1BO60333 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
KIF1BO60333 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.98■■■■□ 3.99
KIF1BO60333 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC39.98■■■■□ 3.99
KIF1BO60333 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.98■■■■□ 3.99
KIF1BO60333 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
KIF1BO60333 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC39.95■■■■□ 3.99
KIF1BO60333 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
KIF1BO60333 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
KIF1BO60333 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC39.93■■■■□ 3.98
KIF1BO60333 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC39.93■■■■□ 3.98
KIF1BO60333 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
KIF1BO60333 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC39.91■■■■□ 3.98
KIF1BO60333 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC39.89■■■■□ 3.98
KIF1BO60333 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC39.89■■■■□ 3.98
KIF1BO60333 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
KIF1BO60333 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.88■■■■□ 3.98
KIF1BO60333 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC39.88■■■■□ 3.98
KIF1BO60333 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
KIF1BO60333 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC39.84■■■■□ 3.97
KIF1BO60333 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC39.84■■■■□ 3.97
KIF1BO60333 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC39.84■■■■□ 3.97
KIF1BO60333 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
KIF1BO60333 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC39.82■■■■□ 3.96
KIF1BO60333 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC39.81■■■■□ 3.96
KIF1BO60333 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
KIF1BO60333 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC39.79■■■■□ 3.96
KIF1BO60333 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC39.79■■■■□ 3.96
KIF1BO60333 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
KIF1BO60333 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
KIF1BO60333 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
KIF1BO60333 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
KIF1BO60333 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
KIF1BO60333 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC39.7■■■■□ 3.95
KIF1BO60333 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.7■■■■□ 3.95
KIF1BO60333 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
KIF1BO60333 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
KIF1BO60333 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC39.65■■■■□ 3.94
KIF1BO60333 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms