Protein–RNA interactions for Protein: O43837

IDH3B, Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IDH3BO43837 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IDH3BO43837 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IDH3BO43837 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
IDH3BO43837 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
IDH3BO43837 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
IDH3BO43837 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IDH3BO43837 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IDH3BO43837 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IDH3BO43837 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
IDH3BO43837 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IDH3BO43837 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
IDH3BO43837 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
IDH3BO43837 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
IDH3BO43837 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
IDH3BO43837 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IDH3BO43837 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IDH3BO43837 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IDH3BO43837 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
IDH3BO43837 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IDH3BO43837 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
IDH3BO43837 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IDH3BO43837 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IDH3BO43837 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IDH3BO43837 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IDH3BO43837 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IDH3BO43837 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IDH3BO43837 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
IDH3BO43837 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IDH3BO43837 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IDH3BO43837 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
IDH3BO43837 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IDH3BO43837 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IDH3BO43837 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IDH3BO43837 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IDH3BO43837 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
IDH3BO43837 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IDH3BO43837 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IDH3BO43837 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IDH3BO43837 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IDH3BO43837 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IDH3BO43837 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IDH3BO43837 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IDH3BO43837 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IDH3BO43837 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IDH3BO43837 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IDH3BO43837 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IDH3BO43837 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IDH3BO43837 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IDH3BO43837 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IDH3BO43837 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IDH3BO43837 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IDH3BO43837 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IDH3BO43837 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IDH3BO43837 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IDH3BO43837 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
IDH3BO43837 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
IDH3BO43837 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IDH3BO43837 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IDH3BO43837 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IDH3BO43837 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IDH3BO43837 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IDH3BO43837 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IDH3BO43837 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IDH3BO43837 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IDH3BO43837 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IDH3BO43837 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IDH3BO43837 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IDH3BO43837 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IDH3BO43837 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IDH3BO43837 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IDH3BO43837 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IDH3BO43837 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IDH3BO43837 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
IDH3BO43837 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IDH3BO43837 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IDH3BO43837 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IDH3BO43837 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IDH3BO43837 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IDH3BO43837 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IDH3BO43837 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IDH3BO43837 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IDH3BO43837 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IDH3BO43837 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IDH3BO43837 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IDH3BO43837 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IDH3BO43837 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
IDH3BO43837 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IDH3BO43837 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IDH3BO43837 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IDH3BO43837 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IDH3BO43837 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IDH3BO43837 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IDH3BO43837 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IDH3BO43837 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IDH3BO43837 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IDH3BO43837 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IDH3BO43837 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IDH3BO43837 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IDH3BO43837 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IDH3BO43837 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms