Protein–RNA interactions for Protein: O14813

PHOX2A, Paired mesoderm homeobox protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2AO14813 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHOX2AO14813 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHOX2AO14813 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHOX2AO14813 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHOX2AO14813 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHOX2AO14813 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHOX2AO14813 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHOX2AO14813 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PHOX2AO14813 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PHOX2AO14813 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHOX2AO14813 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHOX2AO14813 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHOX2AO14813 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHOX2AO14813 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHOX2AO14813 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHOX2AO14813 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHOX2AO14813 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHOX2AO14813 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHOX2AO14813 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHOX2AO14813 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHOX2AO14813 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHOX2AO14813 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHOX2AO14813 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHOX2AO14813 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PHOX2AO14813 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHOX2AO14813 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHOX2AO14813 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHOX2AO14813 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHOX2AO14813 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHOX2AO14813 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHOX2AO14813 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHOX2AO14813 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHOX2AO14813 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHOX2AO14813 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHOX2AO14813 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PHOX2AO14813 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PHOX2AO14813 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PHOX2AO14813 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PHOX2AO14813 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PHOX2AO14813 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PHOX2AO14813 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PHOX2AO14813 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PHOX2AO14813 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PHOX2AO14813 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PHOX2AO14813 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PHOX2AO14813 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHOX2AO14813 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHOX2AO14813 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHOX2AO14813 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHOX2AO14813 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHOX2AO14813 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHOX2AO14813 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHOX2AO14813 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHOX2AO14813 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHOX2AO14813 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHOX2AO14813 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHOX2AO14813 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHOX2AO14813 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHOX2AO14813 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PHOX2AO14813 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PHOX2AO14813 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PHOX2AO14813 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PHOX2AO14813 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PHOX2AO14813 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PHOX2AO14813 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PHOX2AO14813 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PHOX2AO14813 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PHOX2AO14813 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PHOX2AO14813 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PHOX2AO14813 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PHOX2AO14813 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PHOX2AO14813 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHOX2AO14813 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHOX2AO14813 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHOX2AO14813 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHOX2AO14813 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHOX2AO14813 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHOX2AO14813 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHOX2AO14813 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHOX2AO14813 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHOX2AO14813 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHOX2AO14813 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHOX2AO14813 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHOX2AO14813 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHOX2AO14813 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PHOX2AO14813 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PHOX2AO14813 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PHOX2AO14813 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PHOX2AO14813 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PHOX2AO14813 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PHOX2AO14813 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PHOX2AO14813 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PHOX2AO14813 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PHOX2AO14813 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PHOX2AO14813 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PHOX2AO14813 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PHOX2AO14813 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PHOX2AO14813 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PHOX2AO14813 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PHOX2AO14813 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.1 ms