Protein–RNA interactions for Protein: C9JLJ4

USP17L13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L13C9JLJ4 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
USP17L13C9JLJ4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
USP17L13C9JLJ4 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
USP17L13C9JLJ4 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
USP17L13C9JLJ4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
USP17L13C9JLJ4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
USP17L13C9JLJ4 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
USP17L13C9JLJ4 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
USP17L13C9JLJ4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
USP17L13C9JLJ4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
USP17L13C9JLJ4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
USP17L13C9JLJ4 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC32.67■■■□□ 2.82
USP17L13C9JLJ4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
USP17L13C9JLJ4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
USP17L13C9JLJ4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
USP17L13C9JLJ4 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
USP17L13C9JLJ4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
USP17L13C9JLJ4 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
USP17L13C9JLJ4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
USP17L13C9JLJ4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
USP17L13C9JLJ4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
USP17L13C9JLJ4 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
USP17L13C9JLJ4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
USP17L13C9JLJ4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
USP17L13C9JLJ4 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
USP17L13C9JLJ4 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
USP17L13C9JLJ4 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
USP17L13C9JLJ4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
USP17L13C9JLJ4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
USP17L13C9JLJ4 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.78
USP17L13C9JLJ4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
USP17L13C9JLJ4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
USP17L13C9JLJ4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
USP17L13C9JLJ4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
USP17L13C9JLJ4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
USP17L13C9JLJ4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
USP17L13C9JLJ4 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
USP17L13C9JLJ4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
USP17L13C9JLJ4 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
USP17L13C9JLJ4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
USP17L13C9JLJ4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
USP17L13C9JLJ4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
USP17L13C9JLJ4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
USP17L13C9JLJ4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
USP17L13C9JLJ4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
USP17L13C9JLJ4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
USP17L13C9JLJ4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
USP17L13C9JLJ4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC32.32■■■□□ 2.76
USP17L13C9JLJ4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
USP17L13C9JLJ4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
USP17L13C9JLJ4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
USP17L13C9JLJ4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
USP17L13C9JLJ4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC32.28■■■□□ 2.76
USP17L13C9JLJ4 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
USP17L13C9JLJ4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
USP17L13C9JLJ4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
USP17L13C9JLJ4 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
USP17L13C9JLJ4 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
USP17L13C9JLJ4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
USP17L13C9JLJ4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
USP17L13C9JLJ4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
USP17L13C9JLJ4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
USP17L13C9JLJ4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
USP17L13C9JLJ4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
USP17L13C9JLJ4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
USP17L13C9JLJ4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
USP17L13C9JLJ4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
USP17L13C9JLJ4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
USP17L13C9JLJ4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
USP17L13C9JLJ4 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
USP17L13C9JLJ4 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
USP17L13C9JLJ4 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
USP17L13C9JLJ4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
USP17L13C9JLJ4 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
USP17L13C9JLJ4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
USP17L13C9JLJ4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
USP17L13C9JLJ4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
USP17L13C9JLJ4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
USP17L13C9JLJ4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
USP17L13C9JLJ4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
USP17L13C9JLJ4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
USP17L13C9JLJ4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
USP17L13C9JLJ4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
USP17L13C9JLJ4 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
USP17L13C9JLJ4 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
USP17L13C9JLJ4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
USP17L13C9JLJ4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
USP17L13C9JLJ4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
USP17L13C9JLJ4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
USP17L13C9JLJ4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
USP17L13C9JLJ4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.71
USP17L13C9JLJ4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
USP17L13C9JLJ4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
USP17L13C9JLJ4 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
USP17L13C9JLJ4 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
USP17L13C9JLJ4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
USP17L13C9JLJ4 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
USP17L13C9JLJ4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
USP17L13C9JLJ4 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
USP17L13C9JLJ4 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms