Protein–RNA interactions for Protein: B2RTY4

MYO9A, Unconventional myosin-IXa, humanhuman

Predictions only

Length 2,548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO9AB2RTY4 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MYO9AB2RTY4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MYO9AB2RTY4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MYO9AB2RTY4 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MYO9AB2RTY4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
MYO9AB2RTY4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYO9AB2RTY4 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYO9AB2RTY4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MYO9AB2RTY4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
MYO9AB2RTY4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MYO9AB2RTY4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MYO9AB2RTY4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MYO9AB2RTY4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MYO9AB2RTY4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MYO9AB2RTY4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MYO9AB2RTY4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MYO9AB2RTY4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MYO9AB2RTY4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MYO9AB2RTY4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MYO9AB2RTY4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MYO9AB2RTY4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MYO9AB2RTY4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MYO9AB2RTY4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MYO9AB2RTY4 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MYO9AB2RTY4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MYO9AB2RTY4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MYO9AB2RTY4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MYO9AB2RTY4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MYO9AB2RTY4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MYO9AB2RTY4 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
MYO9AB2RTY4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MYO9AB2RTY4 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MYO9AB2RTY4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
MYO9AB2RTY4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYO9AB2RTY4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYO9AB2RTY4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYO9AB2RTY4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYO9AB2RTY4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MYO9AB2RTY4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MYO9AB2RTY4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MYO9AB2RTY4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MYO9AB2RTY4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MYO9AB2RTY4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MYO9AB2RTY4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MYO9AB2RTY4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MYO9AB2RTY4 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MYO9AB2RTY4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MYO9AB2RTY4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MYO9AB2RTY4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MYO9AB2RTY4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MYO9AB2RTY4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MYO9AB2RTY4 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MYO9AB2RTY4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MYO9AB2RTY4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MYO9AB2RTY4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MYO9AB2RTY4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
MYO9AB2RTY4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MYO9AB2RTY4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MYO9AB2RTY4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MYO9AB2RTY4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
MYO9AB2RTY4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MYO9AB2RTY4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MYO9AB2RTY4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MYO9AB2RTY4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MYO9AB2RTY4 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MYO9AB2RTY4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MYO9AB2RTY4 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MYO9AB2RTY4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MYO9AB2RTY4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MYO9AB2RTY4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MYO9AB2RTY4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
MYO9AB2RTY4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
MYO9AB2RTY4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MYO9AB2RTY4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
MYO9AB2RTY4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MYO9AB2RTY4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MYO9AB2RTY4 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
MYO9AB2RTY4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MYO9AB2RTY4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
MYO9AB2RTY4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
MYO9AB2RTY4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MYO9AB2RTY4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MYO9AB2RTY4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MYO9AB2RTY4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MYO9AB2RTY4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MYO9AB2RTY4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MYO9AB2RTY4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MYO9AB2RTY4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MYO9AB2RTY4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MYO9AB2RTY4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MYO9AB2RTY4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MYO9AB2RTY4 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MYO9AB2RTY4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MYO9AB2RTY4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MYO9AB2RTY4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MYO9AB2RTY4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MYO9AB2RTY4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MYO9AB2RTY4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MYO9AB2RTY4 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MYO9AB2RTY4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms