Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00587B1AMM8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00587B1AMM8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
LINC00587B1AMM8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LINC00587B1AMM8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC00587B1AMM8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC00587B1AMM8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00587B1AMM8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00587B1AMM8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00587B1AMM8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00587B1AMM8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00587B1AMM8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC00587B1AMM8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LINC00587B1AMM8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00587B1AMM8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00587B1AMM8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00587B1AMM8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00587B1AMM8 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00587B1AMM8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00587B1AMM8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
LINC00587B1AMM8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
LINC00587B1AMM8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LINC00587B1AMM8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LINC00587B1AMM8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LINC00587B1AMM8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LINC00587B1AMM8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LINC00587B1AMM8 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LINC00587B1AMM8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINC00587B1AMM8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINC00587B1AMM8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LINC00587B1AMM8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LINC00587B1AMM8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC00587B1AMM8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC00587B1AMM8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LINC00587B1AMM8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC00587B1AMM8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC00587B1AMM8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LINC00587B1AMM8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LINC00587B1AMM8 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LINC00587B1AMM8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LINC00587B1AMM8 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LINC00587B1AMM8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LINC00587B1AMM8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LINC00587B1AMM8 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LINC00587B1AMM8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LINC00587B1AMM8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LINC00587B1AMM8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LINC00587B1AMM8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LINC00587B1AMM8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LINC00587B1AMM8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LINC00587B1AMM8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LINC00587B1AMM8 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LINC00587B1AMM8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00587B1AMM8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00587B1AMM8 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00587B1AMM8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00587B1AMM8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00587B1AMM8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00587B1AMM8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00587B1AMM8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00587B1AMM8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00587B1AMM8 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC00587B1AMM8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC00587B1AMM8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC00587B1AMM8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00587B1AMM8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00587B1AMM8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00587B1AMM8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00587B1AMM8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00587B1AMM8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LINC00587B1AMM8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LINC00587B1AMM8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LINC00587B1AMM8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LINC00587B1AMM8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LINC00587B1AMM8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LINC00587B1AMM8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LINC00587B1AMM8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LINC00587B1AMM8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LINC00587B1AMM8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LINC00587B1AMM8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LINC00587B1AMM8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LINC00587B1AMM8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LINC00587B1AMM8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LINC00587B1AMM8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
LINC00587B1AMM8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LINC00587B1AMM8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LINC00587B1AMM8 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LINC00587B1AMM8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LINC00587B1AMM8 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LINC00587B1AMM8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LINC00587B1AMM8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LINC00587B1AMM8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LINC00587B1AMM8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LINC00587B1AMM8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LINC00587B1AMM8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
LINC00587B1AMM8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LINC00587B1AMM8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LINC00587B1AMM8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LINC00587B1AMM8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LINC00587B1AMM8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131 ms