Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ03

CYSRT1, Cysteine-rich tail protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYSRT1A8MQ03 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CYSRT1A8MQ03 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CYSRT1A8MQ03 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CYSRT1A8MQ03 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CYSRT1A8MQ03 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CYSRT1A8MQ03 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CYSRT1A8MQ03 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CYSRT1A8MQ03 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CYSRT1A8MQ03 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CYSRT1A8MQ03 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CYSRT1A8MQ03 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CYSRT1A8MQ03 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CYSRT1A8MQ03 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CYSRT1A8MQ03 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CYSRT1A8MQ03 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CYSRT1A8MQ03 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CYSRT1A8MQ03 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CYSRT1A8MQ03 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CYSRT1A8MQ03 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CYSRT1A8MQ03 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CYSRT1A8MQ03 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CYSRT1A8MQ03 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CYSRT1A8MQ03 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CYSRT1A8MQ03 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CYSRT1A8MQ03 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CYSRT1A8MQ03 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CYSRT1A8MQ03 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CYSRT1A8MQ03 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CYSRT1A8MQ03 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CYSRT1A8MQ03 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CYSRT1A8MQ03 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CYSRT1A8MQ03 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CYSRT1A8MQ03 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CYSRT1A8MQ03 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CYSRT1A8MQ03 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CYSRT1A8MQ03 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CYSRT1A8MQ03 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CYSRT1A8MQ03 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CYSRT1A8MQ03 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CYSRT1A8MQ03 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CYSRT1A8MQ03 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CYSRT1A8MQ03 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CYSRT1A8MQ03 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CYSRT1A8MQ03 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CYSRT1A8MQ03 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CYSRT1A8MQ03 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CYSRT1A8MQ03 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CYSRT1A8MQ03 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CYSRT1A8MQ03 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CYSRT1A8MQ03 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CYSRT1A8MQ03 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CYSRT1A8MQ03 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CYSRT1A8MQ03 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CYSRT1A8MQ03 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CYSRT1A8MQ03 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CYSRT1A8MQ03 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CYSRT1A8MQ03 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CYSRT1A8MQ03 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CYSRT1A8MQ03 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CYSRT1A8MQ03 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CYSRT1A8MQ03 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CYSRT1A8MQ03 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CYSRT1A8MQ03 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CYSRT1A8MQ03 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CYSRT1A8MQ03 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CYSRT1A8MQ03 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CYSRT1A8MQ03 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CYSRT1A8MQ03 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CYSRT1A8MQ03 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYSRT1A8MQ03 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYSRT1A8MQ03 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CYSRT1A8MQ03 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CYSRT1A8MQ03 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CYSRT1A8MQ03 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CYSRT1A8MQ03 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CYSRT1A8MQ03 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CYSRT1A8MQ03 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CYSRT1A8MQ03 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CYSRT1A8MQ03 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CYSRT1A8MQ03 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CYSRT1A8MQ03 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYSRT1A8MQ03 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYSRT1A8MQ03 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYSRT1A8MQ03 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYSRT1A8MQ03 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYSRT1A8MQ03 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYSRT1A8MQ03 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CYSRT1A8MQ03 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CYSRT1A8MQ03 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CYSRT1A8MQ03 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CYSRT1A8MQ03 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CYSRT1A8MQ03 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CYSRT1A8MQ03 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CYSRT1A8MQ03 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYSRT1A8MQ03 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYSRT1A8MQ03 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYSRT1A8MQ03 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CYSRT1A8MQ03 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYSRT1A8MQ03 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYSRT1A8MQ03 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms