Protein–RNA interactions for Protein: A6NNC1

Putative POM121-like protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NNC1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
A6NNC1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
A6NNC1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
A6NNC1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
A6NNC1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
A6NNC1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
A6NNC1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
A6NNC1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
A6NNC1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
A6NNC1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
A6NNC1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
A6NNC1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
A6NNC1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
A6NNC1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
A6NNC1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
A6NNC1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
A6NNC1 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
A6NNC1 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
A6NNC1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
A6NNC1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
A6NNC1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
A6NNC1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
A6NNC1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
A6NNC1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
A6NNC1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
A6NNC1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
A6NNC1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
A6NNC1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
A6NNC1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
A6NNC1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
A6NNC1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
A6NNC1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
A6NNC1 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
A6NNC1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
A6NNC1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
A6NNC1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
A6NNC1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
A6NNC1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
A6NNC1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
A6NNC1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
A6NNC1 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
A6NNC1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
A6NNC1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
A6NNC1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
A6NNC1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
A6NNC1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
A6NNC1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
A6NNC1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
A6NNC1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
A6NNC1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
A6NNC1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
A6NNC1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
A6NNC1 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
A6NNC1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
A6NNC1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
A6NNC1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
A6NNC1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
A6NNC1 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
A6NNC1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
A6NNC1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
A6NNC1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
A6NNC1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
A6NNC1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
A6NNC1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
A6NNC1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
A6NNC1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
A6NNC1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
A6NNC1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
A6NNC1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
A6NNC1 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
A6NNC1 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
A6NNC1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
A6NNC1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
A6NNC1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
A6NNC1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
A6NNC1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
A6NNC1 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
A6NNC1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
A6NNC1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
A6NNC1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
A6NNC1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
A6NNC1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
A6NNC1 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
A6NNC1 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
A6NNC1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
A6NNC1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
A6NNC1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
A6NNC1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
A6NNC1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
A6NNC1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
A6NNC1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
A6NNC1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
A6NNC1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
A6NNC1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
A6NNC1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
A6NNC1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
A6NNC1 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
A6NNC1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
A6NNC1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
A6NNC1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms