Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
GOLGA6L4A6NEF3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
GOLGA6L4A6NEF3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
GOLGA6L4A6NEF3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
GOLGA6L4A6NEF3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
GOLGA6L4A6NEF3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
GOLGA6L4A6NEF3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
GOLGA6L4A6NEF3 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC31.89■■■□□ 2.7
GOLGA6L4A6NEF3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
GOLGA6L4A6NEF3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
GOLGA6L4A6NEF3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
GOLGA6L4A6NEF3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
GOLGA6L4A6NEF3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
GOLGA6L4A6NEF3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
GOLGA6L4A6NEF3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
GOLGA6L4A6NEF3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
GOLGA6L4A6NEF3 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
GOLGA6L4A6NEF3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC31.79■■■□□ 2.68
GOLGA6L4A6NEF3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
GOLGA6L4A6NEF3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
GOLGA6L4A6NEF3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
GOLGA6L4A6NEF3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
GOLGA6L4A6NEF3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC31.76■■■□□ 2.67
GOLGA6L4A6NEF3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
GOLGA6L4A6NEF3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
GOLGA6L4A6NEF3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC31.73■■■□□ 2.67
GOLGA6L4A6NEF3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
GOLGA6L4A6NEF3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
GOLGA6L4A6NEF3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
GOLGA6L4A6NEF3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
GOLGA6L4A6NEF3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
GOLGA6L4A6NEF3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
GOLGA6L4A6NEF3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
GOLGA6L4A6NEF3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
GOLGA6L4A6NEF3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
GOLGA6L4A6NEF3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
GOLGA6L4A6NEF3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
GOLGA6L4A6NEF3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
GOLGA6L4A6NEF3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
GOLGA6L4A6NEF3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
GOLGA6L4A6NEF3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
GOLGA6L4A6NEF3 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
GOLGA6L4A6NEF3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
GOLGA6L4A6NEF3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
GOLGA6L4A6NEF3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
GOLGA6L4A6NEF3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
GOLGA6L4A6NEF3 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
GOLGA6L4A6NEF3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC31.53■■■□□ 2.64
GOLGA6L4A6NEF3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
GOLGA6L4A6NEF3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
GOLGA6L4A6NEF3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
GOLGA6L4A6NEF3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
GOLGA6L4A6NEF3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
GOLGA6L4A6NEF3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
GOLGA6L4A6NEF3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
GOLGA6L4A6NEF3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
GOLGA6L4A6NEF3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
GOLGA6L4A6NEF3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC31.46■■■□□ 2.63
GOLGA6L4A6NEF3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
GOLGA6L4A6NEF3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
GOLGA6L4A6NEF3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
GOLGA6L4A6NEF3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
GOLGA6L4A6NEF3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
GOLGA6L4A6NEF3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
GOLGA6L4A6NEF3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
GOLGA6L4A6NEF3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
GOLGA6L4A6NEF3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
GOLGA6L4A6NEF3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
GOLGA6L4A6NEF3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
GOLGA6L4A6NEF3 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
GOLGA6L4A6NEF3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
GOLGA6L4A6NEF3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
GOLGA6L4A6NEF3 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
GOLGA6L4A6NEF3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
GOLGA6L4A6NEF3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
GOLGA6L4A6NEF3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
GOLGA6L4A6NEF3 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
GOLGA6L4A6NEF3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
GOLGA6L4A6NEF3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
GOLGA6L4A6NEF3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
GOLGA6L4A6NEF3 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
GOLGA6L4A6NEF3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
GOLGA6L4A6NEF3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
GOLGA6L4A6NEF3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
GOLGA6L4A6NEF3 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
GOLGA6L4A6NEF3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
GOLGA6L4A6NEF3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
GOLGA6L4A6NEF3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
GOLGA6L4A6NEF3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
GOLGA6L4A6NEF3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
GOLGA6L4A6NEF3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
GOLGA6L4A6NEF3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
GOLGA6L4A6NEF3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
GOLGA6L4A6NEF3 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
GOLGA6L4A6NEF3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
GOLGA6L4A6NEF3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
GOLGA6L4A6NEF3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.58
GOLGA6L4A6NEF3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms