Protein–RNA interactions for Protein: A6NEE1

PLEKHD1, Pleckstrin homology domain-containing family D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLEKHD1A6NEE1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC44.27■■■■■ 4.68
PLEKHD1A6NEE1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.27■■■■■ 4.68
PLEKHD1A6NEE1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.22■■■■■ 4.67
PLEKHD1A6NEE1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC44.18■■■■■ 4.66
PLEKHD1A6NEE1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC44.18■■■■■ 4.66
PLEKHD1A6NEE1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC44.16■■■■■ 4.66
PLEKHD1A6NEE1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.15■■■■■ 4.66
PLEKHD1A6NEE1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC44.09■■■■■ 4.65
PLEKHD1A6NEE1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC44.08■■■■■ 4.65
PLEKHD1A6NEE1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.06■■■■■ 4.64
PLEKHD1A6NEE1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC44.06■■■■■ 4.64
PLEKHD1A6NEE1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC44.04■■■■■ 4.64
PLEKHD1A6NEE1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC44.04■■■■■ 4.64
PLEKHD1A6NEE1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC44.03■■■■■ 4.64
PLEKHD1A6NEE1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
PLEKHD1A6NEE1 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC43.97■■■■■ 4.63
PLEKHD1A6NEE1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC43.97■■■■■ 4.63
PLEKHD1A6NEE1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC43.94■■■■■ 4.62
PLEKHD1A6NEE1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.94■■■■■ 4.62
PLEKHD1A6NEE1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.94■■■■■ 4.62
PLEKHD1A6NEE1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC43.92■■■■■ 4.62
PLEKHD1A6NEE1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC43.9■■■■■ 4.62
PLEKHD1A6NEE1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC43.89■■■■■ 4.62
PLEKHD1A6NEE1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.88■■■■■ 4.62
PLEKHD1A6NEE1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC43.86■■■■■ 4.61
PLEKHD1A6NEE1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC43.85■■■■■ 4.61
PLEKHD1A6NEE1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC43.85■■■■■ 4.61
PLEKHD1A6NEE1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC43.85■■■■■ 4.61
PLEKHD1A6NEE1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC43.83■■■■■ 4.61
PLEKHD1A6NEE1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC43.8■■■■■ 4.6
PLEKHD1A6NEE1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.79■■■■■ 4.6
PLEKHD1A6NEE1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC43.78■■■■■ 4.6
PLEKHD1A6NEE1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC43.74■■■■■ 4.59
PLEKHD1A6NEE1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC43.72■■■■■ 4.59
PLEKHD1A6NEE1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC43.71■■■■■ 4.59
PLEKHD1A6NEE1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC43.7■■■■■ 4.59
PLEKHD1A6NEE1 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC43.68■■■■■ 4.58
PLEKHD1A6NEE1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC43.68■■■■■ 4.58
PLEKHD1A6NEE1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.67■■■■■ 4.58
PLEKHD1A6NEE1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC43.67■■■■■ 4.58
PLEKHD1A6NEE1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC43.65■■■■■ 4.58
PLEKHD1A6NEE1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC43.64■■■■■ 4.58
PLEKHD1A6NEE1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.63■■■■■ 4.58
PLEKHD1A6NEE1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.63■■■■■ 4.57
PLEKHD1A6NEE1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC43.62■■■■■ 4.57
PLEKHD1A6NEE1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.61■■■■■ 4.57
PLEKHD1A6NEE1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.6■■■■■ 4.57
PLEKHD1A6NEE1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC43.6■■■■■ 4.57
PLEKHD1A6NEE1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC43.6■■■■■ 4.57
PLEKHD1A6NEE1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC43.59■■■■■ 4.57
PLEKHD1A6NEE1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.57■■■■■ 4.57
PLEKHD1A6NEE1 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.57■■■■■ 4.56
PLEKHD1A6NEE1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.55■■■■■ 4.56
PLEKHD1A6NEE1 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.54■■■■■ 4.56
PLEKHD1A6NEE1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.51■■■■■ 4.56
PLEKHD1A6NEE1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC43.51■■■■■ 4.56
PLEKHD1A6NEE1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC43.5■■■■■ 4.55
PLEKHD1A6NEE1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC43.5■■■■■ 4.55
PLEKHD1A6NEE1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC43.49■■■■■ 4.55
PLEKHD1A6NEE1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.49■■■■■ 4.55
PLEKHD1A6NEE1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC43.48■■■■■ 4.55
PLEKHD1A6NEE1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC43.48■■■■■ 4.55
PLEKHD1A6NEE1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.46■■■■■ 4.55
PLEKHD1A6NEE1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.45■■■■■ 4.55
PLEKHD1A6NEE1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC43.44■■■■■ 4.54
PLEKHD1A6NEE1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.43■■■■■ 4.54
PLEKHD1A6NEE1 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.41■■■■■ 4.54
PLEKHD1A6NEE1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC43.39■■■■■ 4.54
PLEKHD1A6NEE1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC43.39■■■■■ 4.54
PLEKHD1A6NEE1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC43.39■■■■■ 4.54
PLEKHD1A6NEE1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC43.38■■■■■ 4.53
PLEKHD1A6NEE1 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC43.37■■■■■ 4.53
PLEKHD1A6NEE1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.37■■■■■ 4.53
PLEKHD1A6NEE1 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC43.37■■■■■ 4.53
PLEKHD1A6NEE1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.36■■■■■ 4.53
PLEKHD1A6NEE1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.32■■■■■ 4.53
PLEKHD1A6NEE1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.32■■■■■ 4.53
PLEKHD1A6NEE1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC43.31■■■■■ 4.52
PLEKHD1A6NEE1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC43.31■■■■■ 4.52
PLEKHD1A6NEE1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC43.3■■■■■ 4.52
PLEKHD1A6NEE1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC43.29■■■■■ 4.52
PLEKHD1A6NEE1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC43.29■■■■■ 4.52
PLEKHD1A6NEE1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC43.28■■■■■ 4.52
PLEKHD1A6NEE1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.27■■■■■ 4.52
PLEKHD1A6NEE1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC43.27■■■■■ 4.52
PLEKHD1A6NEE1 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.25■■■■■ 4.51
PLEKHD1A6NEE1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.23■■■■■ 4.51
PLEKHD1A6NEE1 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
PLEKHD1A6NEE1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC43.23■■■■■ 4.51
PLEKHD1A6NEE1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.2■■■■■ 4.51
PLEKHD1A6NEE1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
PLEKHD1A6NEE1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC43.14■■■■■ 4.5
PLEKHD1A6NEE1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC43.14■■■■■ 4.5
PLEKHD1A6NEE1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC43.14■■■■■ 4.5
PLEKHD1A6NEE1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC43.14■■■■■ 4.5
PLEKHD1A6NEE1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.13■■■■■ 4.5
PLEKHD1A6NEE1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.49
PLEKHD1A6NEE1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
PLEKHD1A6NEE1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
PLEKHD1A6NEE1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC43.12■■■■■ 4.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms