Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQK1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQK1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A0U1RQK1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A0U1RQK1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A0U1RQK1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A0U1RQK1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A0U1RQK1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A0U1RQK1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A0U1RQK1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A0U1RQK1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A0U1RQK1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A0U1RQK1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A0U1RQK1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A0U1RQK1 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A0U1RQK1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A0U1RQK1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A0U1RQK1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A0U1RQK1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A0U1RQK1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A0U1RQK1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A0U1RQK1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A0U1RQK1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A0U1RQK1 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A0U1RQK1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A0U1RQK1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A0U1RQK1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A0U1RQK1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A0U1RQK1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A0U1RQK1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A0U1RQK1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A0U1RQK1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A0U1RQK1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A0U1RQK1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A0U1RQK1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A0U1RQK1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A0U1RQK1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A0U1RQK1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A0U1RQK1 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A0U1RQK1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A0U1RQK1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A0U1RQK1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A0U1RQK1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A0U1RQK1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A0U1RQK1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A0U1RQK1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
A0A0U1RQK1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
A0A0U1RQK1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A0U1RQK1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
A0A0U1RQK1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A0A0U1RQK1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A0U1RQK1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A0U1RQK1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
A0A0U1RQK1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A0U1RQK1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A0U1RQK1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A0U1RQK1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A0U1RQK1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A0U1RQK1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A0U1RQK1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A0U1RQK1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A0U1RQK1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A0U1RQK1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A0U1RQK1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A0U1RQK1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A0U1RQK1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A0U1RQK1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A0U1RQK1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A0U1RQK1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A0U1RQK1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A0U1RQK1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A0U1RQK1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A0U1RQK1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A0U1RQK1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A0U1RQK1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A0U1RQK1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A0U1RQK1 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A0U1RQK1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A0U1RQK1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A0U1RQK1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A0U1RQK1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A0U1RQK1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A0U1RQK1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A0U1RQK1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A0U1RQK1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A0U1RQK1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A0U1RQK1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A0U1RQK1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A0U1RQK1 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A0U1RQK1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A0U1RQK1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A0U1RQK1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
A0A0U1RQK1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A0U1RQK1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A0U1RQK1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A0U1RQK1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A0U1RQK1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A0U1RQK1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A0U1RQK1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A0U1RQK1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A0U1RQK1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A0U1RQK1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms