Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZI9

IFNL3, Interferon lambda-3, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNL3Q8IZI9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
IFNL3Q8IZI9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
IFNL3Q8IZI9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
IFNL3Q8IZI9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
IFNL3Q8IZI9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
IFNL3Q8IZI9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
IFNL3Q8IZI9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
IFNL3Q8IZI9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
IFNL3Q8IZI9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
IFNL3Q8IZI9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
IFNL3Q8IZI9 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
IFNL3Q8IZI9 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
IFNL3Q8IZI9 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
IFNL3Q8IZI9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
IFNL3Q8IZI9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
IFNL3Q8IZI9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
IFNL3Q8IZI9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
IFNL3Q8IZI9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
IFNL3Q8IZI9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
IFNL3Q8IZI9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
IFNL3Q8IZI9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
IFNL3Q8IZI9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
IFNL3Q8IZI9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
IFNL3Q8IZI9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
IFNL3Q8IZI9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
IFNL3Q8IZI9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
IFNL3Q8IZI9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
IFNL3Q8IZI9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
IFNL3Q8IZI9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
IFNL3Q8IZI9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
IFNL3Q8IZI9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
IFNL3Q8IZI9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
IFNL3Q8IZI9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
IFNL3Q8IZI9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
IFNL3Q8IZI9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
IFNL3Q8IZI9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
IFNL3Q8IZI9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
IFNL3Q8IZI9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
IFNL3Q8IZI9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
IFNL3Q8IZI9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
IFNL3Q8IZI9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
IFNL3Q8IZI9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
IFNL3Q8IZI9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
IFNL3Q8IZI9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
IFNL3Q8IZI9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
IFNL3Q8IZI9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
IFNL3Q8IZI9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
IFNL3Q8IZI9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
IFNL3Q8IZI9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
IFNL3Q8IZI9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
IFNL3Q8IZI9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
IFNL3Q8IZI9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
IFNL3Q8IZI9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
IFNL3Q8IZI9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
IFNL3Q8IZI9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
IFNL3Q8IZI9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
IFNL3Q8IZI9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
IFNL3Q8IZI9 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
IFNL3Q8IZI9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
IFNL3Q8IZI9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
IFNL3Q8IZI9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
IFNL3Q8IZI9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
IFNL3Q8IZI9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
IFNL3Q8IZI9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
IFNL3Q8IZI9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
IFNL3Q8IZI9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
IFNL3Q8IZI9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
IFNL3Q8IZI9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
IFNL3Q8IZI9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
IFNL3Q8IZI9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
IFNL3Q8IZI9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
IFNL3Q8IZI9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
IFNL3Q8IZI9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
IFNL3Q8IZI9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
IFNL3Q8IZI9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
IFNL3Q8IZI9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
IFNL3Q8IZI9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
IFNL3Q8IZI9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
IFNL3Q8IZI9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
IFNL3Q8IZI9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
IFNL3Q8IZI9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
IFNL3Q8IZI9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
IFNL3Q8IZI9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
IFNL3Q8IZI9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
IFNL3Q8IZI9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
IFNL3Q8IZI9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
IFNL3Q8IZI9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
IFNL3Q8IZI9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
IFNL3Q8IZI9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
IFNL3Q8IZI9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
IFNL3Q8IZI9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
IFNL3Q8IZI9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
IFNL3Q8IZI9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
IFNL3Q8IZI9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
IFNL3Q8IZI9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
IFNL3Q8IZI9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
IFNL3Q8IZI9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
IFNL3Q8IZI9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
IFNL3Q8IZI9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
IFNL3Q8IZI9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.6 ms