Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZI9

IFNL3, Interferon lambda-3, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNL3Q8IZI9 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC41.02■■■■■ 4.16
IFNL3Q8IZI9 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
IFNL3Q8IZI9 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.81■■■■□ 3.96
IFNL3Q8IZI9 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC39.79■■■■□ 3.96
IFNL3Q8IZI9 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
IFNL3Q8IZI9 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
IFNL3Q8IZI9 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC39.5■■■■□ 3.91
IFNL3Q8IZI9 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC39.03■■■■□ 3.84
IFNL3Q8IZI9 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.77■■■■□ 3.8
IFNL3Q8IZI9 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC38.75■■■■□ 3.79
IFNL3Q8IZI9 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
IFNL3Q8IZI9 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
IFNL3Q8IZI9 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
IFNL3Q8IZI9 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
IFNL3Q8IZI9 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
IFNL3Q8IZI9 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC38.08■■■■□ 3.69
IFNL3Q8IZI9 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
IFNL3Q8IZI9 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC37.86■■■■□ 3.65
IFNL3Q8IZI9 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
IFNL3Q8IZI9 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC37.66■■■■□ 3.62
IFNL3Q8IZI9 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
IFNL3Q8IZI9 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
IFNL3Q8IZI9 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
IFNL3Q8IZI9 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
IFNL3Q8IZI9 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
IFNL3Q8IZI9 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
IFNL3Q8IZI9 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
IFNL3Q8IZI9 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
IFNL3Q8IZI9 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
IFNL3Q8IZI9 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
IFNL3Q8IZI9 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
IFNL3Q8IZI9 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC36.73■■■■□ 3.47
IFNL3Q8IZI9 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
IFNL3Q8IZI9 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
IFNL3Q8IZI9 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC36.61■■■■□ 3.45
IFNL3Q8IZI9 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC36.58■■■■□ 3.45
IFNL3Q8IZI9 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
IFNL3Q8IZI9 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
IFNL3Q8IZI9 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.43
IFNL3Q8IZI9 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
IFNL3Q8IZI9 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
IFNL3Q8IZI9 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
IFNL3Q8IZI9 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
IFNL3Q8IZI9 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC36.24■■■■□ 3.39
IFNL3Q8IZI9 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
IFNL3Q8IZI9 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
IFNL3Q8IZI9 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
IFNL3Q8IZI9 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
IFNL3Q8IZI9 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
IFNL3Q8IZI9 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
IFNL3Q8IZI9 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
IFNL3Q8IZI9 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
IFNL3Q8IZI9 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
IFNL3Q8IZI9 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
IFNL3Q8IZI9 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC35.74■■■■□ 3.31
IFNL3Q8IZI9 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
IFNL3Q8IZI9 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
IFNL3Q8IZI9 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
IFNL3Q8IZI9 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
IFNL3Q8IZI9 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
IFNL3Q8IZI9 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
IFNL3Q8IZI9 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
IFNL3Q8IZI9 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
IFNL3Q8IZI9 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
IFNL3Q8IZI9 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
IFNL3Q8IZI9 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC35.34■■■■□ 3.25
IFNL3Q8IZI9 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
IFNL3Q8IZI9 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
IFNL3Q8IZI9 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
IFNL3Q8IZI9 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
IFNL3Q8IZI9 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
IFNL3Q8IZI9 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
IFNL3Q8IZI9 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
IFNL3Q8IZI9 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
IFNL3Q8IZI9 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
IFNL3Q8IZI9 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
IFNL3Q8IZI9 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
IFNL3Q8IZI9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
IFNL3Q8IZI9 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC34.92■■■■□ 3.18
IFNL3Q8IZI9 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
IFNL3Q8IZI9 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
IFNL3Q8IZI9 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
IFNL3Q8IZI9 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
IFNL3Q8IZI9 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
IFNL3Q8IZI9 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
IFNL3Q8IZI9 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC34.86■■■■□ 3.17
IFNL3Q8IZI9 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
IFNL3Q8IZI9 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
IFNL3Q8IZI9 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
IFNL3Q8IZI9 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
IFNL3Q8IZI9 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC34.71■■■■□ 3.15
IFNL3Q8IZI9 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
IFNL3Q8IZI9 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
IFNL3Q8IZI9 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
IFNL3Q8IZI9 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
IFNL3Q8IZI9 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
IFNL3Q8IZI9 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
IFNL3Q8IZI9 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC34.59■■■■□ 3.13
IFNL3Q8IZI9 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
IFNL3Q8IZI9 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms