Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ6

PARP9, Poly [ADP-ribose] polymerase 9, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP9Q8IXQ6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PARP9Q8IXQ6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PARP9Q8IXQ6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PARP9Q8IXQ6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PARP9Q8IXQ6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PARP9Q8IXQ6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PARP9Q8IXQ6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PARP9Q8IXQ6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PARP9Q8IXQ6 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PARP9Q8IXQ6 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PARP9Q8IXQ6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PARP9Q8IXQ6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PARP9Q8IXQ6 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PARP9Q8IXQ6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PARP9Q8IXQ6 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PARP9Q8IXQ6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PARP9Q8IXQ6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PARP9Q8IXQ6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PARP9Q8IXQ6 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PARP9Q8IXQ6 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PARP9Q8IXQ6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PARP9Q8IXQ6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PARP9Q8IXQ6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PARP9Q8IXQ6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PARP9Q8IXQ6 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PARP9Q8IXQ6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PARP9Q8IXQ6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PARP9Q8IXQ6 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PARP9Q8IXQ6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PARP9Q8IXQ6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PARP9Q8IXQ6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PARP9Q8IXQ6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PARP9Q8IXQ6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PARP9Q8IXQ6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PARP9Q8IXQ6 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PARP9Q8IXQ6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PARP9Q8IXQ6 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PARP9Q8IXQ6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PARP9Q8IXQ6 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PARP9Q8IXQ6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PARP9Q8IXQ6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PARP9Q8IXQ6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PARP9Q8IXQ6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PARP9Q8IXQ6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PARP9Q8IXQ6 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PARP9Q8IXQ6 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PARP9Q8IXQ6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PARP9Q8IXQ6 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PARP9Q8IXQ6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PARP9Q8IXQ6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PARP9Q8IXQ6 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PARP9Q8IXQ6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PARP9Q8IXQ6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PARP9Q8IXQ6 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PARP9Q8IXQ6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PARP9Q8IXQ6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PARP9Q8IXQ6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PARP9Q8IXQ6 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PARP9Q8IXQ6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PARP9Q8IXQ6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PARP9Q8IXQ6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PARP9Q8IXQ6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PARP9Q8IXQ6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PARP9Q8IXQ6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PARP9Q8IXQ6 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PARP9Q8IXQ6 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PARP9Q8IXQ6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PARP9Q8IXQ6 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PARP9Q8IXQ6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PARP9Q8IXQ6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PARP9Q8IXQ6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PARP9Q8IXQ6 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PARP9Q8IXQ6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PARP9Q8IXQ6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PARP9Q8IXQ6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PARP9Q8IXQ6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PARP9Q8IXQ6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PARP9Q8IXQ6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PARP9Q8IXQ6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PARP9Q8IXQ6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PARP9Q8IXQ6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PARP9Q8IXQ6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PARP9Q8IXQ6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PARP9Q8IXQ6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PARP9Q8IXQ6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PARP9Q8IXQ6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PARP9Q8IXQ6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PARP9Q8IXQ6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PARP9Q8IXQ6 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PARP9Q8IXQ6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PARP9Q8IXQ6 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PARP9Q8IXQ6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PARP9Q8IXQ6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PARP9Q8IXQ6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PARP9Q8IXQ6 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PARP9Q8IXQ6 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PARP9Q8IXQ6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PARP9Q8IXQ6 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PARP9Q8IXQ6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PARP9Q8IXQ6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.6 ms