Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SSFA2P28290 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SSFA2P28290 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SSFA2P28290 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SSFA2P28290 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SSFA2P28290 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SSFA2P28290 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SSFA2P28290 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SSFA2P28290 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SSFA2P28290 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SSFA2P28290 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SSFA2P28290 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SSFA2P28290 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SSFA2P28290 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SSFA2P28290 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SSFA2P28290 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SSFA2P28290 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SSFA2P28290 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SSFA2P28290 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SSFA2P28290 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SSFA2P28290 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SSFA2P28290 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SSFA2P28290 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SSFA2P28290 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SSFA2P28290 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SSFA2P28290 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SSFA2P28290 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SSFA2P28290 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SSFA2P28290 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SSFA2P28290 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SSFA2P28290 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SSFA2P28290 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
SSFA2P28290 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
SSFA2P28290 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
SSFA2P28290 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
SSFA2P28290 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SSFA2P28290 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SSFA2P28290 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SSFA2P28290 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SSFA2P28290 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SSFA2P28290 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SSFA2P28290 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SSFA2P28290 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SSFA2P28290 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SSFA2P28290 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SSFA2P28290 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SSFA2P28290 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SSFA2P28290 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SSFA2P28290 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC29■■■□□ 2.23
SSFA2P28290 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SSFA2P28290 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SSFA2P28290 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SSFA2P28290 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SSFA2P28290 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SSFA2P28290 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SSFA2P28290 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
SSFA2P28290 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SSFA2P28290 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SSFA2P28290 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SSFA2P28290 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
SSFA2P28290 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SSFA2P28290 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SSFA2P28290 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SSFA2P28290 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SSFA2P28290 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
SSFA2P28290 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
SSFA2P28290 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
SSFA2P28290 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SSFA2P28290 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SSFA2P28290 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SSFA2P28290 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SSFA2P28290 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SSFA2P28290 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SSFA2P28290 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SSFA2P28290 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SSFA2P28290 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
SSFA2P28290 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
SSFA2P28290 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SSFA2P28290 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SSFA2P28290 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SSFA2P28290 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SSFA2P28290 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SSFA2P28290 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SSFA2P28290 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SSFA2P28290 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
SSFA2P28290 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SSFA2P28290 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SSFA2P28290 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SSFA2P28290 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SSFA2P28290 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SSFA2P28290 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SSFA2P28290 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SSFA2P28290 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SSFA2P28290 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
SSFA2P28290 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SSFA2P28290 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SSFA2P28290 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SSFA2P28290 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SSFA2P28290 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SSFA2P28290 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms