Protein–RNA interactions for Protein: P21953

BCKDHB, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDHBP21953 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BCKDHBP21953 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BCKDHBP21953 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BCKDHBP21953 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BCKDHBP21953 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BCKDHBP21953 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BCKDHBP21953 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BCKDHBP21953 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BCKDHBP21953 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BCKDHBP21953 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BCKDHBP21953 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BCKDHBP21953 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BCKDHBP21953 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BCKDHBP21953 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BCKDHBP21953 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BCKDHBP21953 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BCKDHBP21953 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
BCKDHBP21953 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
BCKDHBP21953 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BCKDHBP21953 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BCKDHBP21953 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BCKDHBP21953 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BCKDHBP21953 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BCKDHBP21953 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BCKDHBP21953 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BCKDHBP21953 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BCKDHBP21953 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BCKDHBP21953 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BCKDHBP21953 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BCKDHBP21953 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BCKDHBP21953 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BCKDHBP21953 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BCKDHBP21953 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BCKDHBP21953 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BCKDHBP21953 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BCKDHBP21953 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BCKDHBP21953 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
BCKDHBP21953 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BCKDHBP21953 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BCKDHBP21953 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
BCKDHBP21953 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BCKDHBP21953 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BCKDHBP21953 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BCKDHBP21953 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BCKDHBP21953 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BCKDHBP21953 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BCKDHBP21953 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BCKDHBP21953 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BCKDHBP21953 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
BCKDHBP21953 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
BCKDHBP21953 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
BCKDHBP21953 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BCKDHBP21953 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCKDHBP21953 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCKDHBP21953 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCKDHBP21953 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCKDHBP21953 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCKDHBP21953 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCKDHBP21953 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCKDHBP21953 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCKDHBP21953 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCKDHBP21953 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCKDHBP21953 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCKDHBP21953 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCKDHBP21953 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCKDHBP21953 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCKDHBP21953 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
BCKDHBP21953 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCKDHBP21953 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
BCKDHBP21953 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCKDHBP21953 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCKDHBP21953 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BCKDHBP21953 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BCKDHBP21953 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BCKDHBP21953 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BCKDHBP21953 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BCKDHBP21953 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
BCKDHBP21953 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BCKDHBP21953 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BCKDHBP21953 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BCKDHBP21953 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BCKDHBP21953 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BCKDHBP21953 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BCKDHBP21953 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BCKDHBP21953 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BCKDHBP21953 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BCKDHBP21953 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BCKDHBP21953 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BCKDHBP21953 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BCKDHBP21953 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BCKDHBP21953 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BCKDHBP21953 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BCKDHBP21953 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BCKDHBP21953 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BCKDHBP21953 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BCKDHBP21953 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BCKDHBP21953 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BCKDHBP21953 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BCKDHBP21953 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BCKDHBP21953 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms