Protein–RNA interactions for Protein: P0C7V0

LINC00271, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00271, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00271P0C7V0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LINC00271P0C7V0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LINC00271P0C7V0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LINC00271P0C7V0 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LINC00271P0C7V0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LINC00271P0C7V0 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LINC00271P0C7V0 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LINC00271P0C7V0 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LINC00271P0C7V0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LINC00271P0C7V0 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LINC00271P0C7V0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LINC00271P0C7V0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LINC00271P0C7V0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LINC00271P0C7V0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LINC00271P0C7V0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LINC00271P0C7V0 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LINC00271P0C7V0 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LINC00271P0C7V0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LINC00271P0C7V0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LINC00271P0C7V0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LINC00271P0C7V0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LINC00271P0C7V0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LINC00271P0C7V0 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
LINC00271P0C7V0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LINC00271P0C7V0 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LINC00271P0C7V0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LINC00271P0C7V0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LINC00271P0C7V0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LINC00271P0C7V0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
LINC00271P0C7V0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LINC00271P0C7V0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LINC00271P0C7V0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LINC00271P0C7V0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LINC00271P0C7V0 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LINC00271P0C7V0 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LINC00271P0C7V0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LINC00271P0C7V0 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LINC00271P0C7V0 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LINC00271P0C7V0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LINC00271P0C7V0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LINC00271P0C7V0 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LINC00271P0C7V0 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LINC00271P0C7V0 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LINC00271P0C7V0 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LINC00271P0C7V0 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LINC00271P0C7V0 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
LINC00271P0C7V0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
LINC00271P0C7V0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LINC00271P0C7V0 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LINC00271P0C7V0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LINC00271P0C7V0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
LINC00271P0C7V0 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LINC00271P0C7V0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LINC00271P0C7V0 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LINC00271P0C7V0 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LINC00271P0C7V0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LINC00271P0C7V0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LINC00271P0C7V0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LINC00271P0C7V0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LINC00271P0C7V0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LINC00271P0C7V0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LINC00271P0C7V0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LINC00271P0C7V0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LINC00271P0C7V0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LINC00271P0C7V0 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LINC00271P0C7V0 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LINC00271P0C7V0 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LINC00271P0C7V0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LINC00271P0C7V0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LINC00271P0C7V0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LINC00271P0C7V0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LINC00271P0C7V0 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LINC00271P0C7V0 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LINC00271P0C7V0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LINC00271P0C7V0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LINC00271P0C7V0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LINC00271P0C7V0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LINC00271P0C7V0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LINC00271P0C7V0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LINC00271P0C7V0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LINC00271P0C7V0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LINC00271P0C7V0 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LINC00271P0C7V0 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LINC00271P0C7V0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LINC00271P0C7V0 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LINC00271P0C7V0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LINC00271P0C7V0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LINC00271P0C7V0 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LINC00271P0C7V0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LINC00271P0C7V0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LINC00271P0C7V0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LINC00271P0C7V0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LINC00271P0C7V0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LINC00271P0C7V0 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LINC00271P0C7V0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
LINC00271P0C7V0 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
LINC00271P0C7V0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LINC00271P0C7V0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LINC00271P0C7V0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
LINC00271P0C7V0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms