Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGB3P05106 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGB3P05106 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGB3P05106 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGB3P05106 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGB3P05106 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGB3P05106 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGB3P05106 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGB3P05106 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGB3P05106 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGB3P05106 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGB3P05106 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGB3P05106 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ITGB3P05106 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ITGB3P05106 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ITGB3P05106 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGB3P05106 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGB3P05106 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGB3P05106 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGB3P05106 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGB3P05106 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGB3P05106 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGB3P05106 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGB3P05106 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGB3P05106 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGB3P05106 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGB3P05106 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGB3P05106 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGB3P05106 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGB3P05106 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGB3P05106 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGB3P05106 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGB3P05106 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGB3P05106 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGB3P05106 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGB3P05106 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGB3P05106 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGB3P05106 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGB3P05106 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGB3P05106 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGB3P05106 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGB3P05106 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGB3P05106 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGB3P05106 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGB3P05106 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGB3P05106 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGB3P05106 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGB3P05106 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGB3P05106 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGB3P05106 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGB3P05106 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGB3P05106 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGB3P05106 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGB3P05106 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGB3P05106 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGB3P05106 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGB3P05106 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGB3P05106 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGB3P05106 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGB3P05106 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGB3P05106 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGB3P05106 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGB3P05106 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGB3P05106 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGB3P05106 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGB3P05106 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGB3P05106 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGB3P05106 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGB3P05106 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGB3P05106 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGB3P05106 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGB3P05106 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGB3P05106 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGB3P05106 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGB3P05106 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGB3P05106 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGB3P05106 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGB3P05106 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGB3P05106 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGB3P05106 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGB3P05106 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGB3P05106 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGB3P05106 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGB3P05106 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGB3P05106 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGB3P05106 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGB3P05106 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGB3P05106 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGB3P05106 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGB3P05106 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGB3P05106 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGB3P05106 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGB3P05106 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGB3P05106 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGB3P05106 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGB3P05106 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGB3P05106 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGB3P05106 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGB3P05106 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGB3P05106 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms