Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FOXD3Q9UJU5 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FOXD3Q9UJU5 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FOXD3Q9UJU5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FOXD3Q9UJU5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FOXD3Q9UJU5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXD3Q9UJU5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXD3Q9UJU5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXD3Q9UJU5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXD3Q9UJU5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXD3Q9UJU5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXD3Q9UJU5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXD3Q9UJU5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXD3Q9UJU5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXD3Q9UJU5 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXD3Q9UJU5 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXD3Q9UJU5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXD3Q9UJU5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXD3Q9UJU5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXD3Q9UJU5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXD3Q9UJU5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXD3Q9UJU5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXD3Q9UJU5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXD3Q9UJU5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXD3Q9UJU5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXD3Q9UJU5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXD3Q9UJU5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXD3Q9UJU5 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXD3Q9UJU5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXD3Q9UJU5 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXD3Q9UJU5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXD3Q9UJU5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXD3Q9UJU5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXD3Q9UJU5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXD3Q9UJU5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXD3Q9UJU5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXD3Q9UJU5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXD3Q9UJU5 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXD3Q9UJU5 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXD3Q9UJU5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXD3Q9UJU5 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXD3Q9UJU5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXD3Q9UJU5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXD3Q9UJU5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXD3Q9UJU5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXD3Q9UJU5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXD3Q9UJU5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXD3Q9UJU5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXD3Q9UJU5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXD3Q9UJU5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXD3Q9UJU5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXD3Q9UJU5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXD3Q9UJU5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXD3Q9UJU5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXD3Q9UJU5 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXD3Q9UJU5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXD3Q9UJU5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXD3Q9UJU5 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXD3Q9UJU5 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXD3Q9UJU5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXD3Q9UJU5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXD3Q9UJU5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXD3Q9UJU5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXD3Q9UJU5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXD3Q9UJU5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXD3Q9UJU5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXD3Q9UJU5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXD3Q9UJU5 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXD3Q9UJU5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXD3Q9UJU5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXD3Q9UJU5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXD3Q9UJU5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXD3Q9UJU5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXD3Q9UJU5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXD3Q9UJU5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXD3Q9UJU5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXD3Q9UJU5 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXD3Q9UJU5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXD3Q9UJU5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXD3Q9UJU5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXD3Q9UJU5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXD3Q9UJU5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXD3Q9UJU5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXD3Q9UJU5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXD3Q9UJU5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXD3Q9UJU5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXD3Q9UJU5 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXD3Q9UJU5 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXD3Q9UJU5 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXD3Q9UJU5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXD3Q9UJU5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXD3Q9UJU5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXD3Q9UJU5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXD3Q9UJU5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXD3Q9UJU5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXD3Q9UJU5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXD3Q9UJU5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXD3Q9UJU5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXD3Q9UJU5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXD3Q9UJU5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms