Protein–RNA interactions for Protein: Q9H816

DCLRE1B, 5' exonuclease Apollo, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1BQ9H816 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DCLRE1BQ9H816 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DCLRE1BQ9H816 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DCLRE1BQ9H816 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DCLRE1BQ9H816 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DCLRE1BQ9H816 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DCLRE1BQ9H816 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DCLRE1BQ9H816 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DCLRE1BQ9H816 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DCLRE1BQ9H816 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DCLRE1BQ9H816 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DCLRE1BQ9H816 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
DCLRE1BQ9H816 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DCLRE1BQ9H816 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DCLRE1BQ9H816 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
DCLRE1BQ9H816 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DCLRE1BQ9H816 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DCLRE1BQ9H816 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DCLRE1BQ9H816 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DCLRE1BQ9H816 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DCLRE1BQ9H816 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DCLRE1BQ9H816 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DCLRE1BQ9H816 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
DCLRE1BQ9H816 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
DCLRE1BQ9H816 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DCLRE1BQ9H816 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DCLRE1BQ9H816 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DCLRE1BQ9H816 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCLRE1BQ9H816 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCLRE1BQ9H816 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCLRE1BQ9H816 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCLRE1BQ9H816 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCLRE1BQ9H816 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCLRE1BQ9H816 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCLRE1BQ9H816 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCLRE1BQ9H816 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCLRE1BQ9H816 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCLRE1BQ9H816 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCLRE1BQ9H816 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCLRE1BQ9H816 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCLRE1BQ9H816 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DCLRE1BQ9H816 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DCLRE1BQ9H816 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DCLRE1BQ9H816 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DCLRE1BQ9H816 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DCLRE1BQ9H816 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DCLRE1BQ9H816 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DCLRE1BQ9H816 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DCLRE1BQ9H816 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DCLRE1BQ9H816 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DCLRE1BQ9H816 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DCLRE1BQ9H816 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DCLRE1BQ9H816 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DCLRE1BQ9H816 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DCLRE1BQ9H816 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DCLRE1BQ9H816 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DCLRE1BQ9H816 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DCLRE1BQ9H816 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DCLRE1BQ9H816 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DCLRE1BQ9H816 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DCLRE1BQ9H816 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DCLRE1BQ9H816 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DCLRE1BQ9H816 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DCLRE1BQ9H816 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DCLRE1BQ9H816 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DCLRE1BQ9H816 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DCLRE1BQ9H816 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DCLRE1BQ9H816 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DCLRE1BQ9H816 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DCLRE1BQ9H816 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
DCLRE1BQ9H816 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DCLRE1BQ9H816 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DCLRE1BQ9H816 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DCLRE1BQ9H816 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DCLRE1BQ9H816 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DCLRE1BQ9H816 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DCLRE1BQ9H816 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DCLRE1BQ9H816 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DCLRE1BQ9H816 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DCLRE1BQ9H816 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DCLRE1BQ9H816 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DCLRE1BQ9H816 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DCLRE1BQ9H816 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DCLRE1BQ9H816 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DCLRE1BQ9H816 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
DCLRE1BQ9H816 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DCLRE1BQ9H816 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DCLRE1BQ9H816 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DCLRE1BQ9H816 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DCLRE1BQ9H816 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DCLRE1BQ9H816 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DCLRE1BQ9H816 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DCLRE1BQ9H816 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DCLRE1BQ9H816 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DCLRE1BQ9H816 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DCLRE1BQ9H816 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DCLRE1BQ9H816 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
DCLRE1BQ9H816 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DCLRE1BQ9H816 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DCLRE1BQ9H816 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms