Protein–RNA interactions for Protein: Q2MV58

TCTN1, Tectonic-1, humanhuman

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCTN1Q2MV58 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCTN1Q2MV58 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TCTN1Q2MV58 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TCTN1Q2MV58 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TCTN1Q2MV58 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TCTN1Q2MV58 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TCTN1Q2MV58 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TCTN1Q2MV58 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TCTN1Q2MV58 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TCTN1Q2MV58 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TCTN1Q2MV58 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TCTN1Q2MV58 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TCTN1Q2MV58 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TCTN1Q2MV58 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TCTN1Q2MV58 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TCTN1Q2MV58 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TCTN1Q2MV58 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TCTN1Q2MV58 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TCTN1Q2MV58 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TCTN1Q2MV58 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TCTN1Q2MV58 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TCTN1Q2MV58 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TCTN1Q2MV58 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TCTN1Q2MV58 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TCTN1Q2MV58 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TCTN1Q2MV58 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TCTN1Q2MV58 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TCTN1Q2MV58 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TCTN1Q2MV58 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TCTN1Q2MV58 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TCTN1Q2MV58 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TCTN1Q2MV58 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TCTN1Q2MV58 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TCTN1Q2MV58 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TCTN1Q2MV58 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TCTN1Q2MV58 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TCTN1Q2MV58 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TCTN1Q2MV58 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TCTN1Q2MV58 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TCTN1Q2MV58 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TCTN1Q2MV58 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TCTN1Q2MV58 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TCTN1Q2MV58 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TCTN1Q2MV58 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TCTN1Q2MV58 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TCTN1Q2MV58 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TCTN1Q2MV58 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TCTN1Q2MV58 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TCTN1Q2MV58 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TCTN1Q2MV58 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TCTN1Q2MV58 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TCTN1Q2MV58 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TCTN1Q2MV58 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TCTN1Q2MV58 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCTN1Q2MV58 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCTN1Q2MV58 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCTN1Q2MV58 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCTN1Q2MV58 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCTN1Q2MV58 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCTN1Q2MV58 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCTN1Q2MV58 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCTN1Q2MV58 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCTN1Q2MV58 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCTN1Q2MV58 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCTN1Q2MV58 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCTN1Q2MV58 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCTN1Q2MV58 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TCTN1Q2MV58 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TCTN1Q2MV58 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TCTN1Q2MV58 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TCTN1Q2MV58 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TCTN1Q2MV58 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TCTN1Q2MV58 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TCTN1Q2MV58 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TCTN1Q2MV58 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TCTN1Q2MV58 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TCTN1Q2MV58 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TCTN1Q2MV58 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TCTN1Q2MV58 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TCTN1Q2MV58 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TCTN1Q2MV58 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TCTN1Q2MV58 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TCTN1Q2MV58 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TCTN1Q2MV58 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TCTN1Q2MV58 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TCTN1Q2MV58 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TCTN1Q2MV58 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TCTN1Q2MV58 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TCTN1Q2MV58 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TCTN1Q2MV58 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TCTN1Q2MV58 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TCTN1Q2MV58 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TCTN1Q2MV58 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TCTN1Q2MV58 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TCTN1Q2MV58 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TCTN1Q2MV58 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TCTN1Q2MV58 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TCTN1Q2MV58 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TCTN1Q2MV58 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TCTN1Q2MV58 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms