Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
ABCC1P33527 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
ABCC1P33527 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
ABCC1P33527 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
ABCC1P33527 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
ABCC1P33527 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
ABCC1P33527 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
ABCC1P33527 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
ABCC1P33527 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
ABCC1P33527 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
ABCC1P33527 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
ABCC1P33527 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
ABCC1P33527 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
ABCC1P33527 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
ABCC1P33527 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
ABCC1P33527 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
ABCC1P33527 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
ABCC1P33527 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
ABCC1P33527 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
ABCC1P33527 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
ABCC1P33527 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
ABCC1P33527 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
ABCC1P33527 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.1
ABCC1P33527 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.1
ABCC1P33527 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.1
ABCC1P33527 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
ABCC1P33527 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
ABCC1P33527 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
ABCC1P33527 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
ABCC1P33527 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
ABCC1P33527 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
ABCC1P33527 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
ABCC1P33527 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
ABCC1P33527 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
ABCC1P33527 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
ABCC1P33527 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
ABCC1P33527 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
ABCC1P33527 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
ABCC1P33527 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
ABCC1P33527 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
ABCC1P33527 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
ABCC1P33527 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
ABCC1P33527 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
ABCC1P33527 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC34.43■■■■□ 3.1
ABCC1P33527 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
ABCC1P33527 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
ABCC1P33527 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
ABCC1P33527 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
ABCC1P33527 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC34.42■■■■□ 3.1
ABCC1P33527 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
ABCC1P33527 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
ABCC1P33527 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
ABCC1P33527 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
ABCC1P33527 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
ABCC1P33527 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
ABCC1P33527 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
ABCC1P33527 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
ABCC1P33527 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC34.4■■■■□ 3.1
ABCC1P33527 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC34.4■■■■□ 3.1
ABCC1P33527 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
ABCC1P33527 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
ABCC1P33527 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
ABCC1P33527 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
ABCC1P33527 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
ABCC1P33527 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
ABCC1P33527 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
ABCC1P33527 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
ABCC1P33527 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
ABCC1P33527 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
ABCC1P33527 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
ABCC1P33527 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
ABCC1P33527 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
ABCC1P33527 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
ABCC1P33527 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
ABCC1P33527 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
ABCC1P33527 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
ABCC1P33527 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
ABCC1P33527 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
ABCC1P33527 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
ABCC1P33527 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
ABCC1P33527 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
ABCC1P33527 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
ABCC1P33527 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
ABCC1P33527 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
ABCC1P33527 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
ABCC1P33527 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
ABCC1P33527 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
ABCC1P33527 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
ABCC1P33527 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
ABCC1P33527 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
ABCC1P33527 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
ABCC1P33527 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
ABCC1P33527 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
ABCC1P33527 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
ABCC1P33527 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
ABCC1P33527 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
ABCC1P33527 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
ABCC1P33527 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
ABCC1P33527 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
ABCC1P33527 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms