Protein–RNA interactions for Protein: P26368

U2AF2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF2P26368 STXBP1-210ENST00000627871 538 ntTSL 321.28■■□□□ 14e-7■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 GPAT3-203ENST00000506766 570 ntTSL 321.2■□□□□ 0.984e-7■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 KBTBD11-OT1-205ENST00000636175 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 521.11■□□□□ 0.974e-7■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.94e-7■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.874e-7■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 RABEP1-206ENST00000575475 2768 ntTSL 1 (best)20.23■□□□□ 0.834e-7■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.824e-7■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 DMGDH-205ENST00000520388 661 ntTSL 420.19■□□□□ 0.824e-7■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.794e-7■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 NPAS1-205ENST00000600352 764 ntTSL 319.98■□□□□ 0.794e-7■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 GPAT3-205ENST00000509412 377 ntTSL 519.8■□□□□ 0.764e-7■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.754e-7■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 SH3BP2-228ENST00000515737 2579 ntTSL 219.55■□□□□ 0.724e-7■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.684e-7■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.674e-7■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.651e-7■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 NPAS1-206ENST00000601169 612 ntTSL 318.95■□□□□ 0.624e-7■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 AL137003.1-202ENST00000450930 635 ntTSL 218.93■□□□□ 0.624e-7■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 NPAS1-204ENST00000594670 763 ntTSL 518.91■□□□□ 0.624e-7■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.64e-7■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.534e-7■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.524e-7■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.494e-7■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 CLN8-206ENST00000523237 835 ntTSL 318.06■□□□□ 0.484e-7■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 SNX17-204ENST00000453453 1638 ntTSL 1 (best)18.04■□□□□ 0.484e-7■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 CLN8-209ENST00000635970 1958 ntTSL 517.74■□□□□ 0.434e-7■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.434e-7■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 NPAS1-203ENST00000594257 498 ntTSL 517.72■□□□□ 0.434e-7■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 DTNB-230ENST00000498437 594 ntTSL 317.69■□□□□ 0.424e-7■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.394e-7■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.394e-7■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.394e-7■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 SH3BP2-229ENST00000515802 2247 ntTSL 217.47■□□□□ 0.394e-7■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 SH3BP2-225ENST00000513069 866 ntTSL 317.15■□□□□ 0.344e-7■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 GPAT3-207ENST00000514309 442 ntTSL 517.08■□□□□ 0.324e-7■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 LRSAM1-205ENST00000472068 850 ntTSL 517.03■□□□□ 0.324e-7■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 MTG2-208ENST00000471962 638 ntTSL 317.03■□□□□ 0.324e-7■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 SYMPK-202ENST00000593504 5107 ntTSL 216.84■□□□□ 0.294e-7■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.273e-13■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 LRSAM1-206ENST00000483302 1994 ntTSL 216.72■□□□□ 0.274e-7■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.274e-7■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.214e-7■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.24e-7■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 SYMPK-215ENST00000600237 5164 ntTSL 516.25■□□□□ 0.194e-7■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.174e-7■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 MTG2-204ENST00000466099 805 ntTSL 515.92■□□□□ 0.144e-7■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 SNAPC4-202ENST00000637388 1398 ntTSL 515.54■□□□□ 0.084e-7■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 STXBP1-217ENST00000637060 3825 ntTSL 515.5■□□□□ 0.074e-7■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 DHX34-201ENST00000328771 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.034e-7■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 STXBP1-202ENST00000373302 3967 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.024e-7■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 STXBP1-221ENST00000637953 3925 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.024e-7■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 AUP1-208ENST00000486234 984 ntTSL 514.89□□□□□ -0.033e-8■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 SYMPK-201ENST00000245934 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.034e-7■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 NUPL2-210ENST00000489145 776 ntTSL 214.74□□□□□ -0.054e-7■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 STXBP1-219ENST00000637464 4893 ntTSL 514.69□□□□□ -0.064e-7■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 STXBP1-220ENST00000637521 2068 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.074e-7■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 SH3BP2-217ENST00000510204 3617 ntTSL 214.5□□□□□ -0.094e-7■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 SYMPK-214ENST00000599814 6537 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.14e-7■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 KBTBD11-OT1-203ENST00000635773 5844 ntAPPRIS ALT2 TSL 514.42□□□□□ -0.14e-7■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 HECTD3-205ENST00000486132 2385 ntTSL 1 (best)14.35□□□□□ -0.113e-13■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 HECTD3-201ENST00000372168 2530 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.153e-13■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 SH3BP2-203ENST00000442312 9211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.164e-7■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 CLN8-212ENST00000637083 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.164e-7■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 STXBP1-218ENST00000637173 4193 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.184e-7■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 AL031686.1-201ENST00000472805 3876 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.194e-7■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 DDIT3-203ENST00000547526 644 ntTSL 313.73□□□□□ -0.214e-7■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 DMGDH-204ENST00000518707 455 ntTSL 213.53□□□□□ -0.244e-7■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 CAPN10-216ENST00000494738 4406 ntTSL 213.51□□□□□ -0.254e-7■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 TMEM165-203ENST00000506103 572 ntTSL 313.15□□□□□ -0.32e-7■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 TRIM23-207ENST00000513794 574 ntTSL 413.11□□□□□ -0.314e-7■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 MC1R-203ENST00000555427 3637 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.324e-7■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 STXBP1-215ENST00000636509 3949 ntTSL 512.82□□□□□ -0.364e-7■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 DDIT3-201ENST00000346473 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.374e-7■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 SH3BP2-209ENST00000504450 844 ntTSL 512.53□□□□□ -0.44e-7■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 TBC1D23-209ENST00000496167 568 ntTSL 512.25□□□□□ -0.456e-14■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 SH3BP2-201ENST00000356331 9211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.464e-7■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 DDIT3-202ENST00000547303 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.464e-7■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 AGPAT3-211ENST00000467358 3955 ntTSL 212.02□□□□□ -0.484e-7■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 STXBP1-209ENST00000626539 3840 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.54e-7■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 PCK1-201ENST00000319441 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.54e-6■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 PCK1-202ENST00000467047 5074 ntTSL 1 (best)11.87□□□□□ -0.514e-6■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 CLN8-201ENST00000331222 7169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.544e-7■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 TRIM23-201ENST00000231524 4186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.544e-7■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 GNL2-209ENST00000538069 698 ntTSL 310.98□□□□□ -0.654e-7■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 MTG2-209ENST00000472005 566 ntTSL 510.91□□□□□ -0.664e-7■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 STXBP1-206ENST00000625363 550 ntTSL 410.73□□□□□ -0.694e-7■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 PAPOLA-216ENST00000555701 1875 ntTSL 210.52□□□□□ -0.734e-7■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 KBTBD11-OT1-204ENST00000635855 6169 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.774e-7■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 AL121722.1-201ENST00000638550 4849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.834e-7■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 EIF2B5-211ENST00000491008 804 ntTSL 29.82□□□□□ -0.844e-7■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 LINC00261-202ENST00000564492 4912 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.874e-7■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 DDIT3-205ENST00000552740 951 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.94e-7■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 RABEP1-201ENST00000341923 2490 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.934e-7■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 USP16-204ENST00000399976 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.034e-8■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 GNL2-204ENST00000469191 533 ntTSL 38.44□□□□□ -1.064e-7■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 DDIT3-204ENST00000551116 1067 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.134e-7■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 USP16-203ENST00000399975 2960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.154e-8■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 DDIT3-206ENST00000623876 1151 nt7.52□□□□□ -1.214e-7■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 SRGAP1-206ENST00000543397 5652 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.234e-7■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 USP16-201ENST00000334352 3004 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.274e-8■■■■■ 30.7
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