Protein–RNA interactions for Protein: P13473

LAMP2, Lysosome-associated membrane glycoprotein 2, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMP2P13473 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMP2P13473 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMP2P13473 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMP2P13473 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMP2P13473 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMP2P13473 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMP2P13473 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMP2P13473 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMP2P13473 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMP2P13473 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMP2P13473 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMP2P13473 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMP2P13473 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMP2P13473 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMP2P13473 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMP2P13473 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMP2P13473 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMP2P13473 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMP2P13473 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMP2P13473 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMP2P13473 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMP2P13473 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMP2P13473 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMP2P13473 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMP2P13473 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMP2P13473 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMP2P13473 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMP2P13473 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMP2P13473 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMP2P13473 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMP2P13473 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMP2P13473 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMP2P13473 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMP2P13473 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMP2P13473 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMP2P13473 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMP2P13473 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMP2P13473 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMP2P13473 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LAMP2P13473 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMP2P13473 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMP2P13473 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMP2P13473 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMP2P13473 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMP2P13473 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMP2P13473 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMP2P13473 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMP2P13473 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMP2P13473 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMP2P13473 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMP2P13473 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMP2P13473 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMP2P13473 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMP2P13473 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMP2P13473 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMP2P13473 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMP2P13473 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMP2P13473 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMP2P13473 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMP2P13473 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMP2P13473 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMP2P13473 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMP2P13473 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMP2P13473 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMP2P13473 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMP2P13473 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMP2P13473 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMP2P13473 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMP2P13473 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMP2P13473 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMP2P13473 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMP2P13473 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMP2P13473 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMP2P13473 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMP2P13473 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMP2P13473 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMP2P13473 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMP2P13473 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMP2P13473 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMP2P13473 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMP2P13473 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMP2P13473 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMP2P13473 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMP2P13473 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMP2P13473 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMP2P13473 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMP2P13473 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMP2P13473 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMP2P13473 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMP2P13473 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMP2P13473 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMP2P13473 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LAMP2P13473 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LAMP2P13473 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LAMP2P13473 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LAMP2P13473 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LAMP2P13473 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LAMP2P13473 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LAMP2P13473 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LAMP2P13473 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms