Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DMDP11532 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DMDP11532 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DMDP11532 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DMDP11532 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DMDP11532 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DMDP11532 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DMDP11532 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DMDP11532 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DMDP11532 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DMDP11532 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DMDP11532 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DMDP11532 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DMDP11532 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DMDP11532 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DMDP11532 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DMDP11532 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DMDP11532 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DMDP11532 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
DMDP11532 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DMDP11532 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
DMDP11532 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DMDP11532 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
DMDP11532 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DMDP11532 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DMDP11532 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DMDP11532 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DMDP11532 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DMDP11532 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DMDP11532 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DMDP11532 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
DMDP11532 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
DMDP11532 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
DMDP11532 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
DMDP11532 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DMDP11532 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DMDP11532 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DMDP11532 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DMDP11532 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DMDP11532 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DMDP11532 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DMDP11532 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DMDP11532 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DMDP11532 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DMDP11532 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DMDP11532 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DMDP11532 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DMDP11532 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
DMDP11532 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DMDP11532 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DMDP11532 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DMDP11532 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DMDP11532 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
DMDP11532 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DMDP11532 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DMDP11532 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DMDP11532 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DMDP11532 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DMDP11532 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DMDP11532 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DMDP11532 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DMDP11532 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DMDP11532 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DMDP11532 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DMDP11532 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
DMDP11532 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DMDP11532 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DMDP11532 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DMDP11532 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DMDP11532 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
DMDP11532 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DMDP11532 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DMDP11532 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DMDP11532 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DMDP11532 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DMDP11532 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DMDP11532 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DMDP11532 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DMDP11532 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DMDP11532 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DMDP11532 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
DMDP11532 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DMDP11532 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
DMDP11532 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
DMDP11532 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
DMDP11532 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
DMDP11532 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DMDP11532 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DMDP11532 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DMDP11532 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DMDP11532 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DMDP11532 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DMDP11532 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DMDP11532 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DMDP11532 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DMDP11532 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DMDP11532 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DMDP11532 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DMDP11532 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DMDP11532 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms