Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GVD1

FAM237B, Family with sequence similarity 237 member B, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM237BA0A1B0GVD1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM237BA0A1B0GVD1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM237BA0A1B0GVD1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM237BA0A1B0GVD1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM237BA0A1B0GVD1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM237BA0A1B0GVD1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM237BA0A1B0GVD1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM237BA0A1B0GVD1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM237BA0A1B0GVD1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM237BA0A1B0GVD1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM237BA0A1B0GVD1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM237BA0A1B0GVD1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM237BA0A1B0GVD1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM237BA0A1B0GVD1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM237BA0A1B0GVD1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM237BA0A1B0GVD1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM237BA0A1B0GVD1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM237BA0A1B0GVD1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FAM237BA0A1B0GVD1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM237BA0A1B0GVD1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM237BA0A1B0GVD1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM237BA0A1B0GVD1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM237BA0A1B0GVD1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM237BA0A1B0GVD1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM237BA0A1B0GVD1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM237BA0A1B0GVD1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM237BA0A1B0GVD1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM237BA0A1B0GVD1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM237BA0A1B0GVD1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM237BA0A1B0GVD1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM237BA0A1B0GVD1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM237BA0A1B0GVD1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM237BA0A1B0GVD1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM237BA0A1B0GVD1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM237BA0A1B0GVD1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM237BA0A1B0GVD1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM237BA0A1B0GVD1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM237BA0A1B0GVD1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM237BA0A1B0GVD1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM237BA0A1B0GVD1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM237BA0A1B0GVD1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM237BA0A1B0GVD1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM237BA0A1B0GVD1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM237BA0A1B0GVD1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM237BA0A1B0GVD1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM237BA0A1B0GVD1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM237BA0A1B0GVD1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM237BA0A1B0GVD1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM237BA0A1B0GVD1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM237BA0A1B0GVD1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM237BA0A1B0GVD1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM237BA0A1B0GVD1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM237BA0A1B0GVD1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM237BA0A1B0GVD1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM237BA0A1B0GVD1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM237BA0A1B0GVD1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM237BA0A1B0GVD1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM237BA0A1B0GVD1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM237BA0A1B0GVD1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM237BA0A1B0GVD1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM237BA0A1B0GVD1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM237BA0A1B0GVD1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM237BA0A1B0GVD1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM237BA0A1B0GVD1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM237BA0A1B0GVD1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM237BA0A1B0GVD1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM237BA0A1B0GVD1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM237BA0A1B0GVD1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM237BA0A1B0GVD1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM237BA0A1B0GVD1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM237BA0A1B0GVD1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM237BA0A1B0GVD1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM237BA0A1B0GVD1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM237BA0A1B0GVD1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM237BA0A1B0GVD1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
FAM237BA0A1B0GVD1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM237BA0A1B0GVD1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM237BA0A1B0GVD1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM237BA0A1B0GVD1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM237BA0A1B0GVD1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM237BA0A1B0GVD1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM237BA0A1B0GVD1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM237BA0A1B0GVD1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM237BA0A1B0GVD1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM237BA0A1B0GVD1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM237BA0A1B0GVD1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM237BA0A1B0GVD1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM237BA0A1B0GVD1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM237BA0A1B0GVD1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM237BA0A1B0GVD1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM237BA0A1B0GVD1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM237BA0A1B0GVD1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM237BA0A1B0GVD1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM237BA0A1B0GVD1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM237BA0A1B0GVD1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM237BA0A1B0GVD1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM237BA0A1B0GVD1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM237BA0A1B0GVD1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM237BA0A1B0GVD1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM237BA0A1B0GVD1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms