Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ75

CASS4, Cas scaffolding protein family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASS4Q9NQ75 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CASS4Q9NQ75 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CASS4Q9NQ75 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CASS4Q9NQ75 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CASS4Q9NQ75 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CASS4Q9NQ75 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CASS4Q9NQ75 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CASS4Q9NQ75 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CASS4Q9NQ75 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CASS4Q9NQ75 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CASS4Q9NQ75 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CASS4Q9NQ75 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CASS4Q9NQ75 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CASS4Q9NQ75 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CASS4Q9NQ75 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CASS4Q9NQ75 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CASS4Q9NQ75 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CASS4Q9NQ75 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CASS4Q9NQ75 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CASS4Q9NQ75 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CASS4Q9NQ75 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CASS4Q9NQ75 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CASS4Q9NQ75 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CASS4Q9NQ75 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CASS4Q9NQ75 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CASS4Q9NQ75 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CASS4Q9NQ75 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CASS4Q9NQ75 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CASS4Q9NQ75 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CASS4Q9NQ75 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CASS4Q9NQ75 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CASS4Q9NQ75 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CASS4Q9NQ75 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CASS4Q9NQ75 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CASS4Q9NQ75 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CASS4Q9NQ75 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CASS4Q9NQ75 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CASS4Q9NQ75 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CASS4Q9NQ75 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CASS4Q9NQ75 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CASS4Q9NQ75 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CASS4Q9NQ75 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CASS4Q9NQ75 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASS4Q9NQ75 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASS4Q9NQ75 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASS4Q9NQ75 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASS4Q9NQ75 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASS4Q9NQ75 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CASS4Q9NQ75 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASS4Q9NQ75 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASS4Q9NQ75 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASS4Q9NQ75 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CASS4Q9NQ75 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASS4Q9NQ75 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASS4Q9NQ75 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASS4Q9NQ75 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASS4Q9NQ75 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASS4Q9NQ75 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASS4Q9NQ75 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASS4Q9NQ75 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASS4Q9NQ75 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASS4Q9NQ75 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASS4Q9NQ75 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASS4Q9NQ75 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASS4Q9NQ75 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASS4Q9NQ75 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CASS4Q9NQ75 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASS4Q9NQ75 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASS4Q9NQ75 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASS4Q9NQ75 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASS4Q9NQ75 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASS4Q9NQ75 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASS4Q9NQ75 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASS4Q9NQ75 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASS4Q9NQ75 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASS4Q9NQ75 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CASS4Q9NQ75 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASS4Q9NQ75 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASS4Q9NQ75 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASS4Q9NQ75 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASS4Q9NQ75 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASS4Q9NQ75 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASS4Q9NQ75 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASS4Q9NQ75 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASS4Q9NQ75 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASS4Q9NQ75 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASS4Q9NQ75 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASS4Q9NQ75 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASS4Q9NQ75 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASS4Q9NQ75 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASS4Q9NQ75 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASS4Q9NQ75 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASS4Q9NQ75 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CASS4Q9NQ75 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CASS4Q9NQ75 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CASS4Q9NQ75 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CASS4Q9NQ75 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CASS4Q9NQ75 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CASS4Q9NQ75 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CASS4Q9NQ75 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms