Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU8

LINC00116, Uncharacterized protein encoded by LINC00116, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00116Q8NCU8 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LINC00116Q8NCU8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LINC00116Q8NCU8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
LINC00116Q8NCU8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
LINC00116Q8NCU8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
LINC00116Q8NCU8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
LINC00116Q8NCU8 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
LINC00116Q8NCU8 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
LINC00116Q8NCU8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
LINC00116Q8NCU8 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
LINC00116Q8NCU8 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
LINC00116Q8NCU8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
LINC00116Q8NCU8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
LINC00116Q8NCU8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
LINC00116Q8NCU8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
LINC00116Q8NCU8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
LINC00116Q8NCU8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
LINC00116Q8NCU8 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
LINC00116Q8NCU8 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
LINC00116Q8NCU8 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
LINC00116Q8NCU8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
LINC00116Q8NCU8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LINC00116Q8NCU8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
LINC00116Q8NCU8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LINC00116Q8NCU8 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
LINC00116Q8NCU8 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
LINC00116Q8NCU8 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
LINC00116Q8NCU8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
LINC00116Q8NCU8 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
LINC00116Q8NCU8 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
LINC00116Q8NCU8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LINC00116Q8NCU8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LINC00116Q8NCU8 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LINC00116Q8NCU8 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
LINC00116Q8NCU8 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LINC00116Q8NCU8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LINC00116Q8NCU8 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LINC00116Q8NCU8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LINC00116Q8NCU8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LINC00116Q8NCU8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LINC00116Q8NCU8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LINC00116Q8NCU8 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LINC00116Q8NCU8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LINC00116Q8NCU8 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
LINC00116Q8NCU8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LINC00116Q8NCU8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LINC00116Q8NCU8 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
LINC00116Q8NCU8 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC29.15■■■□□ 2.26
LINC00116Q8NCU8 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
LINC00116Q8NCU8 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
LINC00116Q8NCU8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LINC00116Q8NCU8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
LINC00116Q8NCU8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
LINC00116Q8NCU8 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
LINC00116Q8NCU8 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
LINC00116Q8NCU8 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
LINC00116Q8NCU8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
LINC00116Q8NCU8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LINC00116Q8NCU8 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LINC00116Q8NCU8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
LINC00116Q8NCU8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
LINC00116Q8NCU8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LINC00116Q8NCU8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LINC00116Q8NCU8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
LINC00116Q8NCU8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LINC00116Q8NCU8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
LINC00116Q8NCU8 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
LINC00116Q8NCU8 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
LINC00116Q8NCU8 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
LINC00116Q8NCU8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LINC00116Q8NCU8 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LINC00116Q8NCU8 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LINC00116Q8NCU8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LINC00116Q8NCU8 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LINC00116Q8NCU8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LINC00116Q8NCU8 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LINC00116Q8NCU8 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LINC00116Q8NCU8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LINC00116Q8NCU8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LINC00116Q8NCU8 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LINC00116Q8NCU8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LINC00116Q8NCU8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LINC00116Q8NCU8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LINC00116Q8NCU8 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
LINC00116Q8NCU8 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
LINC00116Q8NCU8 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
LINC00116Q8NCU8 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
LINC00116Q8NCU8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
LINC00116Q8NCU8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LINC00116Q8NCU8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LINC00116Q8NCU8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LINC00116Q8NCU8 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LINC00116Q8NCU8 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
LINC00116Q8NCU8 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
LINC00116Q8NCU8 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
LINC00116Q8NCU8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LINC00116Q8NCU8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
LINC00116Q8NCU8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LINC00116Q8NCU8 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
LINC00116Q8NCU8 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms