Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNCBQ16143 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNCBQ16143 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNCBQ16143 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SNCBQ16143 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNCBQ16143 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNCBQ16143 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNCBQ16143 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNCBQ16143 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNCBQ16143 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNCBQ16143 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNCBQ16143 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNCBQ16143 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNCBQ16143 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNCBQ16143 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNCBQ16143 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNCBQ16143 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNCBQ16143 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNCBQ16143 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNCBQ16143 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNCBQ16143 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNCBQ16143 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNCBQ16143 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNCBQ16143 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNCBQ16143 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNCBQ16143 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNCBQ16143 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNCBQ16143 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNCBQ16143 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNCBQ16143 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNCBQ16143 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNCBQ16143 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNCBQ16143 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNCBQ16143 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNCBQ16143 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNCBQ16143 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNCBQ16143 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNCBQ16143 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNCBQ16143 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNCBQ16143 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNCBQ16143 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNCBQ16143 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNCBQ16143 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SNCBQ16143 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNCBQ16143 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNCBQ16143 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNCBQ16143 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNCBQ16143 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNCBQ16143 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNCBQ16143 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNCBQ16143 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SNCBQ16143 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNCBQ16143 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SNCBQ16143 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNCBQ16143 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNCBQ16143 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNCBQ16143 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SNCBQ16143 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNCBQ16143 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNCBQ16143 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNCBQ16143 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNCBQ16143 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNCBQ16143 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNCBQ16143 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNCBQ16143 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNCBQ16143 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNCBQ16143 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNCBQ16143 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNCBQ16143 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNCBQ16143 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNCBQ16143 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNCBQ16143 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNCBQ16143 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SNCBQ16143 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNCBQ16143 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNCBQ16143 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNCBQ16143 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNCBQ16143 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNCBQ16143 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNCBQ16143 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNCBQ16143 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNCBQ16143 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNCBQ16143 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNCBQ16143 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNCBQ16143 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNCBQ16143 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNCBQ16143 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNCBQ16143 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNCBQ16143 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNCBQ16143 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNCBQ16143 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNCBQ16143 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNCBQ16143 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNCBQ16143 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNCBQ16143 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNCBQ16143 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNCBQ16143 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNCBQ16143 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNCBQ16143 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNCBQ16143 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms