Protein–RNA interactions for Protein: Q13487

SNAPC2, snRNA-activating protein complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC2Q13487 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SNAPC2Q13487 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SNAPC2Q13487 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SNAPC2Q13487 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SNAPC2Q13487 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SNAPC2Q13487 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SNAPC2Q13487 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SNAPC2Q13487 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SNAPC2Q13487 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SNAPC2Q13487 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SNAPC2Q13487 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SNAPC2Q13487 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SNAPC2Q13487 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SNAPC2Q13487 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SNAPC2Q13487 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SNAPC2Q13487 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SNAPC2Q13487 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SNAPC2Q13487 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SNAPC2Q13487 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SNAPC2Q13487 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SNAPC2Q13487 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SNAPC2Q13487 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SNAPC2Q13487 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SNAPC2Q13487 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SNAPC2Q13487 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SNAPC2Q13487 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SNAPC2Q13487 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SNAPC2Q13487 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SNAPC2Q13487 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SNAPC2Q13487 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNAPC2Q13487 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNAPC2Q13487 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNAPC2Q13487 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNAPC2Q13487 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNAPC2Q13487 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNAPC2Q13487 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNAPC2Q13487 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SNAPC2Q13487 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNAPC2Q13487 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNAPC2Q13487 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNAPC2Q13487 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SNAPC2Q13487 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SNAPC2Q13487 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SNAPC2Q13487 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SNAPC2Q13487 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SNAPC2Q13487 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SNAPC2Q13487 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SNAPC2Q13487 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SNAPC2Q13487 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SNAPC2Q13487 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SNAPC2Q13487 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SNAPC2Q13487 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SNAPC2Q13487 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SNAPC2Q13487 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SNAPC2Q13487 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SNAPC2Q13487 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SNAPC2Q13487 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SNAPC2Q13487 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SNAPC2Q13487 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SNAPC2Q13487 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SNAPC2Q13487 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SNAPC2Q13487 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SNAPC2Q13487 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SNAPC2Q13487 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SNAPC2Q13487 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SNAPC2Q13487 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SNAPC2Q13487 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SNAPC2Q13487 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SNAPC2Q13487 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SNAPC2Q13487 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SNAPC2Q13487 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SNAPC2Q13487 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SNAPC2Q13487 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SNAPC2Q13487 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SNAPC2Q13487 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SNAPC2Q13487 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SNAPC2Q13487 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SNAPC2Q13487 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SNAPC2Q13487 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SNAPC2Q13487 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNAPC2Q13487 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNAPC2Q13487 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNAPC2Q13487 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNAPC2Q13487 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNAPC2Q13487 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SNAPC2Q13487 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNAPC2Q13487 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SNAPC2Q13487 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SNAPC2Q13487 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SNAPC2Q13487 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SNAPC2Q13487 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SNAPC2Q13487 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SNAPC2Q13487 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SNAPC2Q13487 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SNAPC2Q13487 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SNAPC2Q13487 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SNAPC2Q13487 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SNAPC2Q13487 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SNAPC2Q13487 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SNAPC2Q13487 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
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