Protein–RNA interactions for Protein: P50991

CCT4, T-complex protein 1 subunit delta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT4P50991 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCT4P50991 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCT4P50991 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCT4P50991 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCT4P50991 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCT4P50991 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCT4P50991 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCT4P50991 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCT4P50991 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
CCT4P50991 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
CCT4P50991 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCT4P50991 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCT4P50991 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCT4P50991 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCT4P50991 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCT4P50991 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCT4P50991 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCT4P50991 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCT4P50991 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCT4P50991 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCT4P50991 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCT4P50991 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCT4P50991 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCT4P50991 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCT4P50991 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CCT4P50991 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CCT4P50991 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCT4P50991 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCT4P50991 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCT4P50991 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCT4P50991 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCT4P50991 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCT4P50991 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCT4P50991 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCT4P50991 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCT4P50991 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCT4P50991 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCT4P50991 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCT4P50991 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCT4P50991 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCT4P50991 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCT4P50991 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCT4P50991 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCT4P50991 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCT4P50991 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCT4P50991 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCT4P50991 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCT4P50991 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCT4P50991 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCT4P50991 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCT4P50991 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCT4P50991 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCT4P50991 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCT4P50991 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCT4P50991 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCT4P50991 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CCT4P50991 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCT4P50991 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCT4P50991 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCT4P50991 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CCT4P50991 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CCT4P50991 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCT4P50991 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCT4P50991 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCT4P50991 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCT4P50991 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCT4P50991 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCT4P50991 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CCT4P50991 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCT4P50991 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCT4P50991 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCT4P50991 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCT4P50991 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCT4P50991 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCT4P50991 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCT4P50991 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCT4P50991 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCT4P50991 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCT4P50991 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCT4P50991 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCT4P50991 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCT4P50991 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCT4P50991 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCT4P50991 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCT4P50991 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCT4P50991 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCT4P50991 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCT4P50991 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCT4P50991 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCT4P50991 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCT4P50991 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCT4P50991 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCT4P50991 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCT4P50991 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCT4P50991 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCT4P50991 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCT4P50991 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCT4P50991 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCT4P50991 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCT4P50991 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms