Protein–RNA interactions for Protein: P43358

MAGEA4, Melanoma-associated antigen 4, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEA4P43358 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MAGEA4P43358 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MAGEA4P43358 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MAGEA4P43358 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MAGEA4P43358 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MAGEA4P43358 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MAGEA4P43358 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MAGEA4P43358 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MAGEA4P43358 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MAGEA4P43358 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MAGEA4P43358 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MAGEA4P43358 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MAGEA4P43358 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MAGEA4P43358 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MAGEA4P43358 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MAGEA4P43358 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MAGEA4P43358 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MAGEA4P43358 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MAGEA4P43358 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MAGEA4P43358 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MAGEA4P43358 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MAGEA4P43358 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MAGEA4P43358 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MAGEA4P43358 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MAGEA4P43358 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MAGEA4P43358 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MAGEA4P43358 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MAGEA4P43358 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MAGEA4P43358 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MAGEA4P43358 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MAGEA4P43358 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MAGEA4P43358 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MAGEA4P43358 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MAGEA4P43358 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MAGEA4P43358 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MAGEA4P43358 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MAGEA4P43358 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MAGEA4P43358 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MAGEA4P43358 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MAGEA4P43358 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MAGEA4P43358 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MAGEA4P43358 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
MAGEA4P43358 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MAGEA4P43358 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MAGEA4P43358 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MAGEA4P43358 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MAGEA4P43358 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MAGEA4P43358 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MAGEA4P43358 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MAGEA4P43358 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MAGEA4P43358 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MAGEA4P43358 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MAGEA4P43358 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MAGEA4P43358 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MAGEA4P43358 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MAGEA4P43358 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MAGEA4P43358 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MAGEA4P43358 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MAGEA4P43358 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MAGEA4P43358 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MAGEA4P43358 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MAGEA4P43358 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MAGEA4P43358 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MAGEA4P43358 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MAGEA4P43358 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MAGEA4P43358 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MAGEA4P43358 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MAGEA4P43358 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MAGEA4P43358 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MAGEA4P43358 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MAGEA4P43358 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MAGEA4P43358 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MAGEA4P43358 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MAGEA4P43358 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MAGEA4P43358 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MAGEA4P43358 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MAGEA4P43358 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MAGEA4P43358 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MAGEA4P43358 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.27
MAGEA4P43358 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MAGEA4P43358 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MAGEA4P43358 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MAGEA4P43358 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MAGEA4P43358 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MAGEA4P43358 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MAGEA4P43358 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MAGEA4P43358 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MAGEA4P43358 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MAGEA4P43358 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MAGEA4P43358 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MAGEA4P43358 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MAGEA4P43358 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MAGEA4P43358 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MAGEA4P43358 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MAGEA4P43358 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MAGEA4P43358 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MAGEA4P43358 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MAGEA4P43358 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
MAGEA4P43358 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MAGEA4P43358 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms