Protein–RNA interactions for Protein: O75164

KDM4A, Lysine-specific demethylase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4AO75164 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
KDM4AO75164 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
KDM4AO75164 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
KDM4AO75164 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KDM4AO75164 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KDM4AO75164 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
KDM4AO75164 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
KDM4AO75164 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KDM4AO75164 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KDM4AO75164 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KDM4AO75164 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KDM4AO75164 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KDM4AO75164 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KDM4AO75164 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KDM4AO75164 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KDM4AO75164 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KDM4AO75164 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KDM4AO75164 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KDM4AO75164 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KDM4AO75164 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KDM4AO75164 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KDM4AO75164 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KDM4AO75164 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KDM4AO75164 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KDM4AO75164 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KDM4AO75164 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KDM4AO75164 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KDM4AO75164 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KDM4AO75164 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
KDM4AO75164 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
KDM4AO75164 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
KDM4AO75164 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
KDM4AO75164 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KDM4AO75164 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KDM4AO75164 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
KDM4AO75164 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KDM4AO75164 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KDM4AO75164 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KDM4AO75164 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KDM4AO75164 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KDM4AO75164 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KDM4AO75164 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KDM4AO75164 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KDM4AO75164 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KDM4AO75164 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KDM4AO75164 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KDM4AO75164 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
KDM4AO75164 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
KDM4AO75164 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
KDM4AO75164 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
KDM4AO75164 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
KDM4AO75164 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
KDM4AO75164 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KDM4AO75164 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
KDM4AO75164 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KDM4AO75164 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
KDM4AO75164 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KDM4AO75164 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
KDM4AO75164 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KDM4AO75164 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KDM4AO75164 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KDM4AO75164 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KDM4AO75164 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KDM4AO75164 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KDM4AO75164 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KDM4AO75164 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KDM4AO75164 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KDM4AO75164 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KDM4AO75164 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KDM4AO75164 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KDM4AO75164 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KDM4AO75164 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KDM4AO75164 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KDM4AO75164 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KDM4AO75164 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KDM4AO75164 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KDM4AO75164 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KDM4AO75164 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KDM4AO75164 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KDM4AO75164 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KDM4AO75164 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KDM4AO75164 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KDM4AO75164 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KDM4AO75164 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KDM4AO75164 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KDM4AO75164 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KDM4AO75164 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KDM4AO75164 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KDM4AO75164 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KDM4AO75164 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KDM4AO75164 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
KDM4AO75164 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KDM4AO75164 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KDM4AO75164 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KDM4AO75164 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KDM4AO75164 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
KDM4AO75164 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KDM4AO75164 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KDM4AO75164 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
KDM4AO75164 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms